结论：在居间合同协议中，若仅法人盖章而电子版代理人只签名且没有委托书，该合同的效力可能会受到影响，具体取决于多种因素，包括但不限于代理人的权限、合同相对方的认知以及是否构成表见代理等。

分析说明：

1. 代理权限与委托书的重要性：

   • 在法律上，代理人代表法人进行民事法律行为时，通常需要持有有效的授权委托书。委托书是证明代理人具有代理权限的法定文件，它明确了代理人的权限范围、代理事项以及代理期限等关键信息。
   • 若代理人没有委托书而擅自以法人名义签订合同，这可能构成无权代理。无权代理签订的合同，在未经法人追认的情况下，对法人不发生法律效力。

2. 电子版合同的特殊性：

   • 电子版合同与纸质合同在法律上具有同等的效力，但电子版合同的签订和保存方式可能带来一些特殊问题。例如，电子签名的真实性、完整性以及可追溯性等都需要得到确保。
   • 在电子版合同中，若代理人仅签名而没有委托书，且该签名无法被有效验证或与代理人的实际权限不符，那么合同的效力可能会受到质疑。

3. 表见代理的构成与后果：

   • 表见代理是指行为人虽无代理权，但因被代理人的行为造成了足以使善意相对人相信其有代理权的表象，而与善意相对人进行的、由本人承担法律后果的代理行为。
   • 若在居间合同协议中，代理人的行为构成了表见代理（例如，代理人长期以法人名义签订合同且法人未提出异议，或者法人曾向相对方表示代理人有权签订此类合同等），那么即使代理人没有委托书，该合同也可能对法人产生法律效力。

4. 合同相对方的认知与善意：

   • 合同相对方在签订合同时，有义务对代理人的权限进行合理审查。若相对方因疏忽或故意而未审查代理人的委托书，且代理人实际上无权代理，那么相对方可能需承担一定的法律责任。
   • 相反，若相对方在签订合同时已尽到合理审查义务，且基于善意相信代理人具有代理权，那么即使合同最终因代理人无权代理而被认定无效，相对方也可能有权要求法人承担一定的赔偿责任（如信赖利益损失等）。

法律建议：

• 对于法人而言，应严格管理代理人的权限和委托书，确保代理人以法人名义签订合同时持有有效的委托书。同时，应加强对电子版合同签订和保存方式的管理，确保电子签名的真实性和完整性。
• 对于合同相对方而言，在签订合同时应要求代理人出示有效的委托书，并对代理人的权限进行合理审查。若对代理人的权限存在疑问或不确定，应及时向法人进行核实或咨询专业律师的意见。

后续行动：

• 若您作为合同的一方，发现代理人仅签名而没有委托书的情况，且对合同的效力存在疑问，建议您及时咨询专业律师以获取具体的法律建议。
• 若您需要进一步了解表见代理的构成要件、法律后果以及如何防范无权代理风险等，也可以直接向我咨询。