结论前置：居间协议盖合同章在符合相关法律法规及协议约定的情况下通常是有效的，但具体有效性还需结合合同主体、意思表示、内容合法性及印章真实性等多个因素综合判断。
法律依据与一般原则
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着，在居间协议上加盖合同章，作为公司对合同内容认可和愿意受其约束的意思表示，通常符合合同成立的形式要件，会被认定为有效。同时，如果协议中明确规定了盖章生效的条款，或者法律有相关规定或行业惯例，那么盖章后的协议同样具有法律效力。
影响有效性的关键因素
合同主体的民事行为能力：
- 签订居间协议的当事人必须具备相应的民事行为能力。例如，无民事行为能力人签订的居间协议无效；限制民事行为能力人签订的与其年龄、智力、精神健康状况不相适应的居间协议，若未经其法定代理人同意或追认，也可能被认定为无效。
意思表示真实性：
- 双方签订居间协议时的意思表示必须真实。如存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形，导致一方在违背真实意思的情况下签订合同，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构变更或撤销该合同。例如，如果一方通过虚假陈述诱导另一方签订居间协议，那么该协议可能因意思表示不真实而被撤销。
内容合法性：
- 居间协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。若协议约定的居间事项涉及违法活动（如走私、贩毒等），则该协议将被视为无效。例如，如果居间协议中约定的是为非法交易提供居间服务，那么该协议显然违反了法律强制性规定，因此无效。
印章的真实性与一致性：
- 加盖的合同章必须是真实的，且需与协议中约定的或法律规定的印章一致。如使用假章或印章与约定不符，可能导致协议无效或产生法律纠纷。例如，如果公司使用的是已经注销或作废的印章，或者使用的印章与协议中约定的印章不一致，那么该协议可能因印章问题而被认定为无效。
实际操作建议
仔细核对合同内容：
- 在签订居间协议并盖章前，应仔细核对合同内容，确保各方具备相应的民事行为能力，意思表示真实无误，且协议内容合法合规。
严格审查印章的真实性和一致性：
- 应严格审查印章的真实性和一致性，避免使用假章或错误的印章。可以通过查询公司印章备案信息、要求公司出具印章使用证明等方式来确认印章的真实性。
咨询专业法律意见：
- 如有任何疑问或担忧，最好直接向我咨询以获取更准确的法律意见。我可以根据具体情况为你提供针对性的法律建议和解决方案。
综上所述，居间协议盖合同章的有效性并非绝对，而是需综合考虑多个因素。在实际操作中，应谨慎对待每一个细节，以确保协议的合法有效并减少潜在的法律风险。如果你有任何关于居间协议或其他合同纠纷的法律问题，都可以直接向我咨询。