做超工期扣钱是否合法，需分情况讨论：

1. 若超工期是因劳动者自身原因导致，且劳动合同或规章制度中有明确约定：

   • 在这种情况下，如果劳动合同或用人单位的规章制度中明确规定了因劳动者自身原因导致超工期时，用人单位可以扣除相应工资或进行其他处理，并且该规定不违反法律、行政法规的强制性规定，也不存在其他无效情形（如显失公平、欺诈、胁迫等），那么用人单位扣除工资的行为可能是合法的。但需要注意的是，扣除工资的比例和方式必须合理，不能违反《工资支付暂行规定》中关于扣除工资的限制性规定，即每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

2. 若超工期是因用人单位原因导致，或劳动合同、规章制度中无相关规定：

   • 如果超工期是由于用人单位的原因（如生产安排不当、设备故障等）导致的，或者劳动合同、规章制度中并未对超工期扣钱进行明确规定，那么用人单位擅自扣除劳动者工资的行为就是不合法的。劳动者有权要求用人单位支付全额工资，并可以通过协商、调解、投诉、劳动仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。

法律背景与建议：

• 法律背景：根据《中华人民共和国劳动法》和《工资支付暂行规定》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。任何无故拖欠或克扣工资的行为都是违法的。同时，用人单位在制定规章制度时，必须遵循合法、合理、公平的原则，并经过民主程序与劳动者协商确定。

• 建议：

  • 对于劳动者而言，如果遇到超工期扣钱的情况，首先应当查看自己的劳动合同和用人单位的规章制度，了解是否有相关规定。如果认为用人单位的行为违法或不合理，可以与用人单位进行协商，要求支付全额工资。
  • 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者依法申请劳动仲裁、提起诉讼，以维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果用人单位违法扣除劳动者工资，除了需要支付被扣除的工资外，还可能面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，劳动者的合法权益受到侵害的，还有权要求用人单位支付赔偿金。

综上所述，做超工期扣钱是否合法取决于具体情况和劳动合同、规章制度中的约定。劳动者在遇到此类情况时，应当了解自己的权益和维权途径，以便及时采取有效措施进行保护。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。