结论：地上车库无产权证时，仅通过签订协议能否收回车库，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、协议内容与性质
协议内容合法有效：
- 如果双方签订的协议内容合法、明确，且不违反法律法规的强制性规定，那么该协议在双方之间是具有法律效力的。
- 协议中应明确车库的使用权、收益权、转让权等关键条款，以及收回车库的条件和程序。
协议性质：
- 若协议被认定为租赁合同，则根据《民法典》中关于租赁合同的规定，出租人有权在租赁期限届满或满足特定条件时收回租赁物。
- 若协议被认定为其他类型的合同，如使用权转让合同，则需根据合同的具体约定和法律规定来判断收回车库的可能性。
二、车库权属与登记情况
车库权属：
- 地上车库的权属可能因开发方式、规划用途等因素而有所不同。有些车库可能属于开发商所有，有些则可能属于业主共有或特定业主所有。
- 在无产权证的情况下，车库的权属可能难以直接确定，需要通过其他证据（如购房合同、规划图纸等）来辅助证明。
登记情况：
- 产权证是证明物权归属的重要法律文件。如果车库未办理产权证，则可能无法直接通过产权登记来确认权属。
- 未办理产权证的车库，在交易或处分时可能面临更多的法律风险和不确定性。
三、收回车库的可行性与风险
可行性：
- 如果协议内容合法有效，且车库权属明确（尽管无产权证），且满足协议中约定的收回条件，那么理论上可以通过签订协议来收回车库。
- 然而，在实际操作中，由于车库无产权证，可能面临权属争议、执行困难等问题。
风险：
- 权属争议风险：无产权证的车库可能存在权属不清的情况，导致收回过程中产生争议。
- 执行困难风险：即使协议有效且权属明确，如果对方不配合或拒绝履行协议，收回车库可能需要通过法律途径解决，这可能涉及诉讼、执行等复杂程序。
- 法律风险：如果协议内容存在违法或不当之处，可能导致协议无效或被撤销，从而影响收回车库的计划。
四、建议与措施
- 完善协议内容：在签订协议时，应确保协议内容合法、明确、具体，并明确约定收回车库的条件和程序。
- 收集证据：尽可能收集与车库权属相关的证据（如购房合同、规划图纸、付款凭证等），以辅助证明车库的权属。
- 咨询专业律师：在签订协议或面临收回车库的问题时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
- 考虑其他方式：如果协议收回车库存在困难或风险较大，可以考虑通过协商、调解、诉讼等其他方式来解决争议。
总结：地上车库无产权证时，仅通过签订协议能否收回车库取决于多种因素，包括协议内容、车库权属、登记情况以及实际操作中的可行性和风险等。因此，在处理此类问题时，应谨慎对待并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。