无产权车库转让协议的合法性需分情况讨论，具体如下：

1. 若车库属于业主共有部分：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，建筑区划内，规划用于停放汽车的车位、车库的归属，由当事人通过出售、附赠或者出租等方式约定。但是，占用业主共有的道路或者其他场地用于停放汽车的车位，属于业主共有。
   • 若车库属于业主共有部分，如占用公共道路或场地建设的车库，则其所有权归全体业主共有，单个业主无权私自转让。此时，无产权车库转让协议因违反法律强制性规定而无效。

2. 若车库属于开发商所有且未计入公摊面积：

   • 开发商在开发建设过程中，若车库未计入公摊面积，且未作为公共部分进行规划，则开发商可能保留车库的所有权。
   • 在此情况下，若开发商与受让人签订无产权车库转让协议，且该协议不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，则协议可能具有法律效力。但需注意，由于车库无产权，受让人可能无法办理产权过户手续，从而面临一定的法律风险。

3. 若车库属于人防工程：

   • 根据相关规定，人防工程平时由投资者使用管理，收益归投资者所有。在部分地区，人防工程可能被改造为车库使用。
   • 若车库属于人防工程，则其所有权可能归国家所有，投资者仅享有使用权。此时，无产权车库转让协议可能涉及使用权的转让，而非所有权的转让。该协议的合法性需根据当地法律法规及人防工程的具体管理规定进行判断。

法律建议：

• 在签订无产权车库转让协议前，务必核实车库的所有权归属情况，确保转让方有权进行转让。
• 咨询当地房地产管理部门或专业律师，了解车库转让的具体法律法规及政策要求。
• 考虑协议中的风险条款，如因车库产权问题导致的纠纷处理方式、违约责任等，以降低法律风险。

可能法律后果：

• 若无产权车库转让协议被认定为无效，则双方需恢复原状，即受让人需将车库返还给转让方，转让方需退还受让人已支付的款项。
• 若因车库产权问题导致纠纷，双方可能需承担诉讼费用、律师费用等额外支出。

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