子公司给母公司开具发票是合法且合规的，但前提是双方之间存在真实、合法、有效的交易行为，并且必须严格遵守相关法律法规和税务规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、子公司的法律地位与开票权利
子公司作为具有独立法人资格的主体，根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，它依法独立承担民事责任。这意味着子公司与母公司在法律上是两个完全独立的实体，各自享有独立的权利和承担独立的义务。因此，当子公司与母公司之间发生真实的交易行为，如销售货物、提供劳务等，子公司基于其向母公司履行的合同义务和产生的应税行为，有权利也有义务按照税法规定向母公司开具发票。
二、开票行为的合规性要求
交易真实性：子公司向母公司开具发票时，必须确保交易的真实性。交易内容、金额、税率等必须与实际交易相符，这是避免税务风险的基础。
合法性与有效性：开票行为需严格遵守相关税收法规和财务制度要求。子公司应确保所开具的发票符合税务部门的规定，包括发票的格式、内容、开具时间等，以确保税务处理的合规性。
税务处理：子公司与母公司之间的交易如果属于应税行为，子公司需要按照规定计算缴纳增值税等税费，并向母公司开具合规的发票。这是子公司履行纳税义务的体现，也是母公司进行税务处理（如进项税额抵扣）的合法凭证。
三、关联交易中的特别注意事项
在子公司与母公司的关联交易中，双方应特别注意遵守相关法律法规，确保交易的公平性和合理性。根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司的控股股东、实际控制人、董事、监事、高级管理人员不得利用其关联关系损害公司利益。因此，为避免利益输送或损害其他股东利益的行为发生，子公司与母公司之间的交易价格应公允、条件应合理。双方应通过协商或其他合法方式确定交易价格和条件，并确保这些价格和条件的公正性和透明度。
四、实际操作中的建议
确保发票的合法性、真实性和准确性：子公司给母公司开具发票时，应仔细核对发票的各项信息，确保无误。
遵守相关税法规定：子公司应熟悉并遵守增值税法、企业所得税法等相关税法规定，确保交易的税务处理符合法律法规要求。
咨询专业意见：如遇复杂情况或疑问，子公司应及时咨询专业的法律顾问或税务专家，以确保交易的合规性。
综上所述，子公司给母公司开具发票是合法且合规的商业行为，但前提是双方之间存在真实、合法、有效的交易行为，并且必须严格遵守相关法律法规和税务规定。在关联交易中，双方还应特别注意确保交易的公平性和合理性，以维护各自的合法权益和公司的整体利益。