双方当事人在未进行工伤认定及劳动能力鉴定的情况下达成工伤赔偿协议，一般不能直接申请司法确认，但存在例外情况。以下从不同角度进行分析：

一、一般情况：不能直接申请司法确认

1. 司法确认的前提：司法确认程序通常适用于双方当事人就民事权利义务关系已经达成调解协议，且该调解协议具有可执行性。在工伤赔偿领域，这意味着双方需要就工伤赔偿的具体数额、支付方式等核心条款达成一致，并且该一致意见是基于明确的工伤事实和劳动能力鉴定结果。
2. 工伤认定与劳动能力鉴定的必要性：工伤认定是确定工伤事实的基础，而劳动能力鉴定则是确定工伤职工伤残等级和护理依赖程度的关键。没有这两项程序，工伤赔偿协议可能缺乏客观、公正的依据，导致赔偿数额的确定存在主观性和不确定性。因此，在未进行工伤认定及劳动能力鉴定的情况下，双方达成的赔偿协议可能无法满足司法确认程序对调解协议可执行性的要求。

二、例外情况：可能申请司法确认

1. 双方自愿且协议内容明确：尽管未进行工伤认定及劳动能力鉴定，但如果双方当事人自愿达成赔偿协议，并且协议内容明确、具体，包括赔偿数额、支付方式、支付时间等核心条款，且不存在欺诈、胁迫等情形，那么该协议在法律上可能是有效的。然而，即使如此，由于缺乏工伤认定和劳动能力鉴定的客观依据，该协议在执行过程中可能面临争议和风险。
2. 法院或仲裁机构的审查与确认：在某些特殊情况下，如果双方当事人能够提供其他证据证明工伤事实和伤残程度（如医疗记录、证人证言等），并且法院或仲裁机构认为这些证据足以支持赔偿协议的合理性，那么可能会对赔偿协议进行审查并确认其效力。但这种情况较为罕见，且需要满足严格的证据标准和审查程序。

三、法律建议

1. 优先进行工伤认定和劳动能力鉴定：为了确保工伤赔偿协议的合法性和有效性，建议双方当事人在达成赔偿协议前，先进行工伤认定和劳动能力鉴定。这样不仅可以为赔偿协议提供客观、公正的依据，还可以减少后续争议和风险。
2. 谨慎达成赔偿协议：如果双方当事人确实希望在没有进行工伤认定和劳动能力鉴定的情况下达成赔偿协议，那么应当谨慎对待。建议双方在协议中明确约定赔偿数额的计算方式、支付方式、支付时间等核心条款，并考虑设置一定的保障措施（如担保、违约金等）以确保协议的履行。
3. 寻求专业法律帮助：在处理工伤赔偿问题时，建议双方当事人寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、协助进行工伤认定和劳动能力鉴定、起草和审查赔偿协议等服务，以确保双方当事人的合法权益得到保障。

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