劳动仲裁中，与运营签订的合作协议是否有效，需根据协议具体内容及双方实际法律关系来判断。以下从不同角度进行分析：

一、合作协议的法律性质

合作协议，本质上是一种合同，其法律效力取决于合同双方的真实意思表示、合同内容是否合法以及是否违反法律、行政法规的强制性规定。如果合作协议是双方自愿签订，内容合法，且没有违反法律、行政法规的强制性规定，那么该协议通常是有效的。

二、劳动仲裁中的法律关系

在劳动仲裁中，关键在于判断双方是否存在劳动关系。劳动关系是指用人单位与劳动者之间，依法所确立的劳动过程中的权利义务关系。如果双方签订的是合作协议，但实际履行过程中形成了劳动关系（如一方提供劳动，另一方支付工资，且存在管理与被管理的关系），那么该合作协议可能被视为劳动合同的变种或补充，其效力将受到劳动法律法规的调整。

1. 若实际为劳动关系：

   • 即使双方签订的是合作协议，但如果实际履行过程中符合劳动关系的特征，那么该协议中的某些条款（如关于工作时间、工资支付、社会保险等）可能因违反劳动法律法规的强制性规定而无效。
   • 在这种情况下，劳动者可以依据劳动法律法规，通过劳动仲裁或诉讼途径维护自己的合法权益。

2. 若实际为合作关系：

   • 如果双方签订的合作协议确实体现了合作关系的特征（如共同投资、共享收益、共担风险等），且没有违反法律、行政法规的强制性规定，那么该协议通常是有效的。
   • 在这种情况下，双方应按照合作协议的约定履行各自的义务，如因合作协议产生纠纷，应通过民事诉讼等途径解决。

三、法律建议

1. 审查协议内容：在签订合作协议前，应仔细审查协议内容，确保协议条款合法、合规，并明确双方的权利义务关系。
2. 明确法律关系：在签订协议时，应明确双方的法律关系是劳动关系还是合作关系，以便在后续履行过程中避免纠纷。
3. 寻求法律帮助：如果对合作协议的法律效力或双方的法律关系存在疑问，建议寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。

总结来说，劳动仲裁中与运营签订的合作协议是否有效，需根据协议具体内容及双方实际法律关系来判断。如果实际为劳动关系，则可能受到劳动法律法规的调整；如果实际为合作关系，则通常按照合作协议的约定履行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。