机构更名一般不算在两个单位任职，但具体需结合劳动合同的履行情况及实际工作关系来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 从法律主体变更的角度

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位变更名称、法定代表人、主要负责人或者投资人等事项，不影响劳动合同的履行。这意味着，如果机构仅仅是更名，而其他主体信息（如法定代表人、主要负责人、投资人等）未发生变更，且劳动合同继续履行，那么员工并未在法律上与两个不同的单位建立劳动关系。
   • 举例来说，若员工与“A公司”签订了劳动合同，后“A公司”更名为“B公司”，但劳动合同的条款、工作内容、工作地点等均未发生变化，且员工继续为“B公司”工作，那么员工并未在两个单位任职，而是与同一法律主体（尽管名称变更）保持了劳动关系。

2. 从实际工作关系及劳动合同履行的角度

   • 如果机构更名后，员工的工作内容、工作地点、劳动报酬等劳动合同的关键条款发生了显著变化，或者更名后的机构与原机构在业务、管理等方面存在实质性差异，导致员工实际上是在为两个不同的实体工作，那么这种情况可能被视为在两个单位任职。
   • 然而，这种情况下的判断需要具体分析劳动合同的履行情况、更名后机构的实际情况以及员工的工作状态等因素。如果更名并未导致劳动合同的实质性变更，且员工继续为同一实体提供劳动，那么通常不会认定为在两个单位任职。

3. 从社保缴纳及工龄计算的角度

   • 在社保缴纳方面，如果机构更名后，员工的社保账户信息（如单位名称、社保编号等）进行了相应变更，但社保缴纳的连续性未受影响，那么员工的社保缴纳记录不会因机构更名而中断。
   • 在工龄计算方面，如果员工在机构更名前后的工作年限能够连续计算，且更名并未导致员工与用人单位之间的劳动关系中断，那么员工的工龄不会因机构更名而受到影响。这也进一步支持了机构更名一般不算在两个单位任职的观点。

建议：

• 对于员工而言，如果所在机构发生更名，应及时与用人单位确认劳动合同的履行情况、社保缴纳及工龄计算等相关事宜，以确保自身权益不受影响。
• 如果机构更名后，员工发现自己的劳动合同、社保缴纳或工龄计算等方面存在问题或疑虑，建议及时咨询专业律师或相关劳动部门，以维护自己的合法权益。

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