劳动合同中的工资一般不包含加班费，但在特定条件下，双方可以约定综合工资内包含加班费。以下是对这一问题的详细分析：
一、合同有明确约定的情况
包含加班费且合法有效：
- 如果劳动合同中明确约定综合工资包含加班费，并且用人单位能够提供充分证据证明已按照约定支付了加班费，同时折算后的正常工作时间工资不低于当地最低工资标准，那么这种约定在司法实践中通常会被认定为有效。例如，合同中写明“月综合工资XX元，包含正常工作时间工资及加班费”，且用人单位的工资条等证据能显示加班费已合理计算在内，且折算后的正常工作时间工资高于当地最低工资标准。
包含加班费但可能无效的情况：
- 若约定的综合工资中虽包含加班费，但经计算劳动者的加班工资低于法定的加班工资标准（即平时加班为工资的150%，休息日加班又不能安排补休的为工资的200%，法定节假日加班为工资的300%），这种约定无效。
- 用人单位不得通过约定综合工资包含加班费的方式，规避其应支付的加班工资责任。任何违反《劳动法》关于加班时间和加班工资规定的约定均属无效。
二、合同未明确约定的情况
- 在劳动合同未明确约定综合工资是否包含加班费的情况下，司法实践一般认为工资不包含加班费。因为根据《中华人民共和国劳动法》和《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位安排劳动者延长工作时间的，应当支付高于正常工作时间工资的工资报酬。这意味着加班费是对劳动者额外劳动付出的补偿，与正常工作时间的工资是分开的。
三、合法约定的条件与建议
协商一致：
- 用人单位必须与劳动者明确协商，并达成一致意见，才能在劳动合同中约定综合工资包含加班费。如果用人单位单方面在合同中规定，未经劳动者同意，这种约定难以得到法律支持。
合理性与合法性：
- 约定的综合工资标准应合理，能够确保劳动者在正常工作时间获得不低于当地最低工资标准的报酬。
- 综合计算下来，该综合工资所对应的加班工资应不低于按照法定标准计算的加班工资数额。
明确具体条款：
- 劳动合同中应明确约定加班费的计算基数、比例和支付方式。避免使用模糊或不确定的表述，以减少后续纠纷的发生。
实际操作建议：
- 用人单位在与劳动者签订劳动合同时，应明确约定综合工资中是否包含加班费以及具体的计算方式。如果约定包含加班费，应详细列明加班费的计算基数、比例和支付时间。
- 用人单位应严格遵守《劳动法》关于加班时间的规定，确保劳动者的身体健康和合法权益。在支付加班工资时，应按照法定标准或劳动合同约定的标准及时足额支付。
- 用人单位应与劳动者进行充分沟通，解释劳动合同中关于加班费和综合工资的约定内容。确保劳动者对合同约定有清晰的理解，避免后续因理解不一致而产生的纠纷。
总结与建议：劳动合同中的工资一般不包含加班费，除非有明确的合同约定且符合法律法规的要求。因此，劳动者在与用人单位签订劳动合同时，应仔细审查合同条款，确保自己的合法权益得到保障。如果合同中存在关于综合工资包含加班费的约定，劳动者应要求用人单位提供充分的证据来证明其合法性，并确保折算后的正常工作时间工资不低于当地最低工资标准。在发生争议时，劳动者可以依法维护自己的权益，要求用人单位按照法律规定支付加班费。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。