保密协议纠纷是否可以不经过劳动仲裁，取决于纠纷的具体性质和涉及的法律关系，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、属于劳动仲裁受理范围的情况

如果保密协议是劳动者与用人单位在劳动关系存续期间签订的，且纠纷内容涉及保密义务、竞业限制、保密费用支付等与劳动权益直接相关的争议，那么这类纠纷通常属于劳动仲裁的受理范围。例如：

• 用人单位未支付保密费用：若用人单位未按照保密协议约定支付保密费用或竞业限制补偿金，劳动者可以通过劳动仲裁来维护自己的权益。
• 劳动者违反保密协议：若劳动者违反保密协议，给用人单位造成经济损失，用人单位同样可以通过劳动仲裁来追究劳动者的责任。

在这种情况下，保密协议纠纷需要经过劳动仲裁程序。劳动仲裁委员会将依法进行裁决，以公正、高效地解决双方的争议。

二、不属于劳动仲裁受理范围的情况

如果保密协议的签订主体并非劳动者与用人单位这种基于劳动关系的主体，而是平等民事主体之间（如企业与企业、企业与非员工个人等）签订的保密协议，因保密条款履行发生的争议则不属于劳动仲裁的受理范围。例如：

• 企业与企业之间的保密协议纠纷：若两家企业之间签订了保密协议，并因保密条款的履行发生争议，这类纠纷应通过民事诉讼等途径来解决。
• 企业与非员工个人之间的保密协议纠纷：若企业与非员工个人签订了保密协议，并因保密条款的履行发生争议，同样应通过民事诉讼等途径来解决。

在这种情况下，保密协议纠纷不需要经过劳动仲裁程序，而是应直接向人民法院提起民事诉讼。

三、保密协议纠纷的解决途径

对于保密协议纠纷，除了上述提到的劳动仲裁和民事诉讼途径外，双方还可以尝试通过协商、调解等方式来解决争议。这些方式具有灵活性和高效性，有助于双方快速达成和解协议，避免不必要的法律纠纷。

四、法律建议

1. 明确纠纷性质：在发生保密协议纠纷时，首先要明确纠纷的性质和涉及的法律关系，以确定是否属于劳动仲裁的受理范围。
2. 选择合适的解决途径：根据纠纷的性质和实际情况，选择合适的解决途径。如果属于劳动仲裁的受理范围，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；如果不属于劳动仲裁的受理范围，则应向人民法院提起民事诉讼。
3. 保留相关证据：在处理保密协议纠纷时，要保留好相关证据，如保密协议、履行协议的证据、损失证明等，以便在仲裁或诉讼过程中证明自己的主张。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议。