结论：翻建时未被认定为违章建筑，建成后仍然有可能被认定为违章建筑，这主要取决于翻建行为是否符合相关法律法规和规划要求。
分析说明：
违章建筑的认定标准：
- 违章建筑通常指的是未经规划部门批准，擅自改变土地用途、建筑用途或超出规划许可范围进行建设的建筑物。这种认定并不局限于建设过程中，而是贯穿于建筑物的整个生命周期。
翻建行为的合法性：
- 翻建行为本身需要获得相关部门的批准，包括规划许可、施工许可等。如果翻建时未获得这些许可，或者翻建后的建筑物不符合规划要求，那么即使翻建时未被认定为违章建筑，建成后也有可能因为不符合相关法律法规而被认定为违章建筑。
建成后的认定程序：
- 建成后的建筑物，如果相关部门在后续的监管或检查中发现其存在违章行为，如未经批准擅自改变用途、超出规划许可范围等，仍然可以对其进行违章建筑的认定，并采取相应的处罚措施，如责令拆除、罚款等。
法律建议：
- 合规翻建：在进行翻建行为前，务必确保获得所有必要的许可和批准，并严格按照规划要求进行建设，以避免后续被认定为违章建筑。
- 及时咨询：如果对翻建行为的合法性或规划要求存在疑问，建议及时咨询当地规划部门或专业律师，以确保翻建行为的合规性。
- 应对认定：如果建成后被认定为违章建筑，应积极配合相关部门的处理工作，如接受罚款、拆除等处罚，并尽快采取措施纠正违章行为，以减少损失和影响。
可能后果：
- 如果翻建后的建筑物被认定为违章建筑，可能会面临被责令拆除、罚款等处罚措施。这不仅会造成经济损失，还可能影响建筑物的使用功能和安全性。因此，务必确保翻建行为的合规性，以避免不必要的法律风险和损失。
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