结论前置：根据您描述的情况，如果合同中明确约定了保底工资，且您已经按照合同约定履行了前两个月的工作义务，那么第三个月离职时，用人单位不给保底工资的做法通常是不合适的，可能违反了合同约定和法律规定。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同约定的法律效力
合同约定优先：在劳动关系中，劳动合同是双方权利义务的基础。如果合同中明确约定了保底工资，那么这一条款对双方都具有法律约束力。用人单位应当按照合同约定支付保底工资，不得随意变更或拒绝支付。
合同变更需协商：如果用人单位想要变更合同中的保底工资条款，应当与劳动者进行协商，并达成一致意见。未经劳动者同意，用人单位单方面变更合同条款的行为是无效的。
二、离职时的工资支付
离职工资结算：根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者离职时，用人单位应当一次性结清劳动者的工资。这包括劳动者已经提供劳动应得的工资，以及合同中约定的其他福利待遇，如保底工资等。
不得克扣工资：用人单位不得以任何理由克扣劳动者的工资。如果用人单位以劳动者离职为由拒绝支付保底工资，那么这种行为可能构成克扣工资，违反了法律规定。
三、可能的法律后果
劳动者维权：如果用人单位拒绝支付保底工资，劳动者可以通过劳动争议调解仲裁机构或人民法院进行维权。在维权过程中，劳动者需要提供合同、工资条等证据来证明自己的主张。
用人单位责任：如果用人单位被认定存在克扣工资的行为，那么除了需要支付拖欠的工资外，还可能需要承担支付赔偿金等法律责任。赔偿金的数额通常根据拖欠工资的数额和拖欠时间等因素来确定。
四、建议与行动
审查合同：首先，建议您仔细审查与用人单位签订的劳动合同，确认合同中是否明确约定了保底工资条款，以及该条款的具体内容。
与用人单位沟通：如果合同中确实约定了保底工资，而用人单位拒绝支付，您可以先与用人单位进行沟通，了解其拒绝支付的原因，并尝试协商解决。
寻求法律援助：如果沟通无果，您可以向当地的劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，或者向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
最后，如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。作为专注于婚姻家庭、合同纠纷、拆迁安置领域的专业律师，我将竭诚为您提供专业的法律服务。