公司从员工工资中扣除考证培训费，这一行为是否合法以及相应的法律责任，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、合法性判断
若公司事先与员工有明确约定：
- 根据《劳动合同法》及相关规定，如果公司在员工入职时或培训前，已经与员工签订了书面协议，明确约定了考证培训费的承担方式（如由员工承担，并从工资中扣除），且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司从员工工资中扣除考证培训费的行为可能是合法的。
- 但需注意：即使有约定，扣除的费用也不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。这是为了保护员工的基本生活需求。
若公司事先未与员工明确约定：
- 如果公司未与员工签订任何书面协议，或者协议中未明确约定考证培训费的承担方式，那么公司擅自从员工工资中扣除考证培训费的行为可能是违法的。
- 在这种情况下，员工有权要求公司返还被扣除的费用，并可能向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
二、法律责任
若公司行为合法：
- 公司无需承担法律责任，但需确保扣除的费用符合上述限制条件（即不超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不低于当地最低工资标准）。
若公司行为违法：
- 返还费用：公司需返还被非法扣除的考证培训费给员工。
- 赔偿损失：如果因公司的违法行为给员工造成了其他损失（如因工资减少而无法支付必要的生活费用等），公司还需承担相应的赔偿责任。
- 行政处罚：公司还可能面临劳动监察部门的行政处罚，如罚款、责令改正等。
三、建议与行动
对于员工：
- 首先查看自己与公司签订的劳动合同或相关协议，了解是否有关于考证培训费承担方式的约定。
- 如果公司擅自扣除了考证培训费，且未事先与员工约定，员工可以向公司提出异议，并要求返还被扣除的费用。
- 如果公司拒绝返还，员工可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
对于公司：
- 在要求员工承担考证培训费前，应与员工签订书面协议，明确约定费用的承担方式。
- 确保扣除的费用符合法律法规的限制条件，避免违法扣除。
- 如果因特殊情况需要调整扣除比例或方式，应与员工协商一致，并签订补充协议。
总结来说，公司从员工工资中扣除考证培训费的行为是否合法，取决于是否事先与员工有明确约定以及扣除的费用是否符合法律法规的限制条件。如果公司行为违法，将承担返还费用、赔偿损失和可能面临的行政处罚等法律责任。员工在遇到此类问题时，应首先查看相关协议，然后与公司协商或向相关部门投诉以维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。