在单价合同中，若施工单位未进行变更申报但实际发生了变更，结算方式需根据合同约定及实际变更情况综合确定，具体如下：
合同有明确变更条款时：
- 若合同中明确规定了变更的申报、审批及结算流程（如变更需在发生后X日内书面申报，逾期视为放弃调整权利等），施工单位未按规定申报的，可能面临无法主张变更部分价款的风险。此时，结算原则上按原合同单价执行，但若发包人实际接受了变更成果且未提出异议，可结合《民法典》中关于合同变更的公平原则，通过协商或诉讼主张合理调整价款。
- 关键点：合同条款的效力优先，但未申报不必然丧失权利，需结合实际履行情况及公平原则综合判断。
合同无明确变更条款时：
- 根据《民法典》第五百四十三条，当事人协商一致可以变更合同。若实际变更已发生且发包人未提出异议（如通过验收、使用变更部分等），可视为双方以实际行为变更了合同内容。此时，结算可参照以下原则：
- 工程量变更：按实际完成的工程量乘以合同单价结算；若工程量增加导致单价合理性变化（如规模效应消失），可主张调整单价。
- 工作内容变更：若变更涉及新增工作内容（如原合同未包含的施工项目），可参照类似项目单价或市场价协商确定；无类似项目的，可通过造价鉴定确定合理价格。
- 关键点：以实际履行情况为依据，结合公平原则和行业惯例确定结算方式。
发包人未确认变更但实际受益时：
- 若施工单位未申报变更，但发包人实际接受了变更成果（如未提出质量异议、已投入使用等），可主张发包人构成“默示接受”。此时，结算可参照实际变更情况主张价款，但需承担举证责任（如施工记录、验收文件、沟通记录等）。
- 关键点：举证是关键，需通过证据证明发包人实际接受了变更且未提出异议。
施工单位未申报变更的后果：
- 若合同明确约定未申报变更的后果（如视为放弃调整权利、承担违约责任等），施工单位可能面临无法主张变更价款或需赔偿发包人损失的风险。此时，需结合合同条款的合理性及实际履行情况判断条款效力（如显失公平的条款可能被部分或全部撤销）。
- 关键点：合同条款的合理性审查是核心，需避免因条款显失公平导致权利失衡。
建议行动：
- 立即补报变更：若变更尚未最终结算，建议施工单位尽快书面补报变更申请，并附相关证据（如施工记录、验收文件等），争取发包人确认。
- 协商解决：若补报困难，可与发包人协商结算方式，重点围绕实际变更情况、公平原则及行业惯例展开。
- 法律途径：若协商无果，可依据《民法典》及相关司法解释，通过诉讼或仲裁主张合理价款，同时做好证据收集和举证准备。
总结：单价合同中未申报变更的结算需结合合同约定、实际履行情况及法律原则综合判断。建议施工单位在发生变更时及时申报，避免权利受损；若已发生未申报变更，需通过协商或法律途径争取合理结算。如有具体问题，可直接向我咨询。