在国有企业被合并的情况下，员工的处理方式及权益保障是一个涉及法律、经济和人力资源等多个层面的重要问题。以下是对此问题的详细解答：

一、劳动合同的处理与继续有效

根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条的规定，当国有企业被合并时，原劳动合同并不会因此失效，而是由承继其权利和义务的新用人单位继续履行。这意味着，员工无需重新签订劳动合同，他们的工作岗位、薪酬待遇、工作地点等原则上应保持不变。当然，如果合并后的企业因经营战略调整或业务整合需要变更劳动合同内容，如岗位、薪酬等，必须与员工进行协商，并达成书面一致意见，未经员工同意，企业不得单方面更改合同内容。

二、员工安置方案与权益保障

在国有企业合并过程中，应制定详细的员工安置方案。这个方案需要经过职工代表大会或全体职工的讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。方案应涵盖人员去向、补偿标准、社保接续等重要事项，以确保员工的知情权和参与权。安置方案可能包括内部转岗、待岗、提前退休等多种方式。内部转岗是将员工调整到新企业内的其他合适岗位；待岗期间，企业需按规定发放生活费；符合条件的员工还可以申请提前退休。

三、经济补偿的支付与标准

如果企业与员工协商一致解除劳动合同，或者因法定原因导致劳动合同无法继续履行而解除时，企业需要支付经济补偿。经济补偿的计算通常依据员工在本单位的工作年限和工资标准。具体来说，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付；六个月以上不满一年的按一年计算；不满六个月的支付半个月工资的经济补偿。对于月工资高于当地职工月平均工资三倍的员工，按其月工资的三倍数额支付，但最高不超过十二年。这里的月工资指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

四、社会保险和住房公积金的接续

合并后的企业应及时办理员工的社会保险和住房公积金相关手续，确保缴纳不中断。员工的社保和公积金关系由新企业承继，继续按规定基数和比例缴纳，以保障员工在养老、医疗、失业、工伤、生育等方面的权益以及住房公积金的相关权益。

五、沟通与解释工作

在整个合并过程中，企业应及时向员工通报合并的相关信息，包括合并的原因、目的、影响以及后续安排等，以消除员工的疑虑和不安。同时，企业应鼓励员工提出问题和建议，积极回应员工的关切和需求，增强员工的归属感和认同感。

综上所述，国有企业被合并时，员工的处理方式应严格依法进行，确保员工的合法权益得到充分保障。同时，企业应积极与员工沟通协商，制定合理的安置方案和经济补偿标准，以促进企业合并的顺利进行并维护社会稳定和谐。