工程质量保修书中施工单位的负责人签字并不必然是项目经理，具体分析如下：

一、法律与合同层面的规定

在工程质量保修书的签署上，法律并未明确规定必须由项目经理签字。工程质量保修书作为建设工程施工合同的一部分，其签署主体主要依据合同双方的约定。因此，如果合同中明确约定了由项目经理作为施工单位的代表签署工程质量保修书，那么项目经理的签字就是有效的。但如果合同中没有这样的约定，或者约定了其他人员作为签署代表，那么就不一定需要项目经理签字。

二、项目经理的职责与权限

项目经理是施工单位在工程项目上的全权代表，负责项目的整体管理和协调工作。然而，这并不意味着项目经理必须签署所有与项目相关的文件。项目经理的职责和权限通常由施工单位的内部管理制度和合同约定来确定。在一些情况下，项目经理可能会授权其他人员代表其签署某些文件，包括工程质量保修书。

三、实际操作中的常见做法

在实际操作中，工程质量保修书的签署可能会因项目规模、施工单位的管理制度以及合同约定等因素而有所不同。对于一些大型项目或重要项目，施工单位可能会要求由更高层级的管理人员或法定代表人签署工程质量保修书，以确保文件的权威性和有效性。而对于一些小型项目或常规项目，项目经理或其授权的人员签署工程质量保修书则可能更为常见。

四、建议与注意事项

1. 仔细审查合同条款：在签署工程质量保修书之前，施工单位应仔细审查合同条款，明确签署代表的身份和权限，以避免因签署问题而引发的纠纷。
2. 完善内部管理制度：施工单位应建立健全内部管理制度，明确各级管理人员的职责和权限，确保在签署各类文件时能够遵循规定的程序和要求。
3. 保留相关证据：在签署工程质量保修书时，施工单位应保留好相关的证据材料，如授权委托书、签署人员的身份证明等，以备不时之需。

如果您在工程质量保修书的签署过程中遇到任何问题或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。