业主方可以使用商票支付在建工程款，但需满足一定条件并注意相关法律风险。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定角度：

   • 如果业主方与承包方在建设工程施工合同中明确约定了可以使用商业承兑汇票（商票）作为工程款的支付方式，那么这种支付方式是合法有效的。双方应按照合同约定履行各自的义务，包括商票的开具、接收、承兑等。

2. 法律规定角度：

   • 根据《中华人民共和国票据法》等相关法律法规，商票作为一种票据形式，具有流通性、无因性等特点。只要商票的开具、背书、承兑等环节符合法律规定，商票就可以作为合法的支付手段。
   • 然而，需要注意的是，商票的承兑依赖于出票人的信用，如果出票人（即业主方）信用不佳或资金状况出现问题，可能导致商票无法按时承兑，从而给承包方带来损失。

3. 风险防控角度：

   • 对于承包方而言，接受商票作为工程款支付方式时，应充分评估业主方的信用状况和资金实力，以降低商票无法承兑的风险。
   • 双方可以在合同中约定商票无法承兑时的违约责任和赔偿方式，以便在出现问题时能够及时维护自身权益。
   • 承包方还可以考虑要求业主方提供担保或增加其他保障措施，以进一步降低风险。

4. 实际操作角度：

   • 在实际操作中，商票的开具、背书、承兑等环节需要遵循一定的流程和规范。双方应确保这些环节的合法性和有效性，以避免因操作不当而引发的法律纠纷。
   • 如果双方对商票的使用存在争议或问题，可以及时咨询专业律师或相关机构，以获取专业的法律意见和帮助。