商票用于支付工程款是否合规，取决于双方合同支付协议的具体内容。以下是对此问题的详细分析：

一. 商票支付合规性的判断依据

1. 合同支付协议的约定：
   • 如果合同支付协议中明确约定了可以使用商票作为支付工具，那么商票支付工程款就是合规的。
   • 相反，如果合同支付协议中没有约定或明确禁止使用商票支付，那么商票支付工程款就可能构成违约行为，从而引发合规性问题。

二. 商票支付可能存在的法律风险

1. 商票无法承兑的风险：

   • 商业承兑汇票是以承兑人的信用作为担保，存在到期无法承兑的风险。若商票无法承兑，施工单位可能面临工程款无法收回的困境。
   • 我的建议：施工单位在接受商票支付前，应审核承兑企业的信用及支付能力，并尽量在合同中明确约定到期无法承兑的违约责任或延期付款利息。

2. 丧失优先受偿权的风险：

   • 根据《合同法》第286条及《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释(二)》规定，施工单位在建设单位欠付工程款时，对建设工程折价或拍卖的价款享有优先受偿权，优先权的期限为六个月。若建设单位以商票支付工程款，且商票到期无法承兑，施工单位可能因超过优先受偿权期限而丧失该权利。
   • 我的建议：施工单位在接受商票支付时，应与建设单位明确约定，在商票无法承兑时，施工单位仍有权要求建设单位支付工程款并享有优先受偿权。

三. 商票支付合规性的实践建议

1. 明示的商票支付：

   • 双方应在合同文本中直接约定以商票的方式支付工程款，避免暗示或被迫接受商票支付的情况。

2. 审核承兑企业资质：

   • 在接受商票支付前，施工单位应仔细审核承兑企业的信用状况、经营情况及支付能力，确保商票能够按期承兑。

3. 明确合同条款：

   • 合同中应明确约定商票的出票人、承兑人、付款期限、违约责任及贴现费用承担等关键条款，以防范潜在的法律风险。

综上所述，商票用于支付工程款是否合规，主要取决于双方合同支付协议的具体内容。同时，施工单位在接受商票支付时，应充分评估潜在的法律风险，并采取相应措施予以防范。如有进一步需要，您可以继续咨询我。