结论：楼上已经拆除卫生间改造的情况下，您仍然有可能起诉，但具体能否胜诉及获得赔偿，需根据改造行为是否曾造成实际损害、是否违反相关法律法规或管理规约，以及您能否提供充分证据等因素综合判断。
一、起诉的法律依据与可行性
侵权责任基础：
- 根据《民法典》的相关规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。若楼上改造卫生间的行为曾违反该原则，对您造成损害（如漏水、噪音等），即使现已拆除，您仍有权基于侵权责任要求赔偿。
起诉的时效性：
- 诉讼时效通常为三年，自您知道或应当知道权利受到损害之日起计算。若改造行为发生在三年内，且您能证明该行为曾对您造成损害，则起诉在时效上是可行的。
二、起诉的关键因素与证据收集
实际损害的存在：
- 您需要证明楼上改造卫生间的行为曾对您造成实际损害，如房屋结构受损、漏水导致的财产损失、噪音干扰等。这通常需要提供照片、视频、维修记录、鉴定报告等证据。
改造行为的违法性：
- 若改造行为违反了《住宅室内装饰装修管理办法》等相关规定，或未经相关部门批准，或违反了物业管理规约，这将增强您起诉的法律依据。
证据的充分性与关联性：
- 证据应充分且直接关联到改造行为与您所受损害之间的因果关系。例如，漏水照片应显示漏水点与楼上改造卫生间的位置关系，维修记录应详细记录维修原因及费用等。
三、可能面临的挑战与应对策略
证据收集难度：
- 由于改造行为已拆除，部分证据可能已灭失或难以收集。此时，您应尽快联系物业、邻居或相关部门，尝试获取改造前的照片、视频或书面记录等间接证据。
损害程度的鉴定：
- 若损害程度难以直接观察或评估，您可能需要委托专业机构进行鉴定。鉴定报告将作为关键证据，用于证明损害的存在及程度。
协商与调解：
- 在起诉前，您可以尝试与楼上业主进行协商或请求物业、居委会等第三方进行调解。若能达成和解协议，则无需通过诉讼解决纠纷。
四、建议与行动步骤
咨询专业律师：
- 在决定起诉前，建议您咨询专业律师，对案件进行全面评估。律师将根据您的具体情况，提供针对性的法律建议和诉讼策略。
收集并整理证据：
- 尽快收集并整理与改造行为及损害相关的所有证据，包括照片、视频、维修记录、鉴定报告等。确保证据的充分性与关联性。
考虑起诉或协商：
- 根据律师的建议和证据情况，决定是否起诉。若决定起诉，则按照法院的要求准备起诉材料并提起诉讼；若决定协商或调解，则积极与楼上业主或相关部门进行沟通。
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