股东会三年到期，原总经理并不会自动离职。这一结论主要基于以下几点法律和实务分析：

1. 总经理的任期与股东会任期无直接关联：

   • 总经理的任期通常由公司章程或董事会决定，并受《公司法》等相关法律法规的约束。股东会的任期，一般是指股东会作为公司的权力机构，其成员（股东）的任期或股东会会议的召开周期等，但这并不直接决定总经理的任期。
   • 除非公司章程或相关协议中明确规定了总经理的任期与股东会任期挂钩，或者股东会决议中明确提及了总经理的任期问题，否则总经理的任期不会因股东会任期的到期而自动终止。

2. 总经理离职需遵循法定程序：

   • 如果总经理希望离职，或者公司希望解聘总经理，通常需要遵循一定的法定程序，如提前通知、召开董事会会议进行决议等。
   • 自动离职的说法在法律上并不成立，除非存在特定的合同条款或法律规定允许在特定条件下自动离职。

3. 实务操作中的注意事项：

   • 在实务中，公司应明确总经理的任期、解聘条件等，并在公司章程或相关协议中予以明确约定，以避免不必要的纠纷。
   • 如果股东会任期到期后，公司希望更换总经理或进行其他人事调整，应依法进行，并确保所有程序都符合法律法规和公司章程的规定。

建议：

• 如果您是公司的股东或管理层，面对股东会任期到期的情况，建议首先审查公司章程和相关协议，了解总经理的任期和解聘条件。
• 如果需要更换总经理或进行其他人事调整，应依法召开董事会会议进行决议，并确保所有程序都符合法律法规和公司章程的规定。
• 如果您是原总经理，且对任期或离职问题存在疑问，建议与公司管理层或法律顾问进行沟通，以明确自己的权益和义务。

如有任何进一步的法律疑问或需要具体的法律建议，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。