结论前置：在申请支付令后，若公司提出异议，您确实可以选择去申请劳动仲裁来维护自己的权益。以下是对此问题的详细分析：

一、支付令与异议的法律背景

支付令是人民法院根据债权人的申请，向债务人发出的限期履行给付金钱或有价证券的法律文书。若债务人在法定期间内既不提出书面异议，又不履行支付令的，债权人可以向人民法院申请强制执行。然而，如果债务人（在此场景下为公司）在法定期间内提出了书面异议，那么支付令将自行失效，债权人不能直接依据支付令申请强制执行。

二、公司提出异议后的法律路径

1. 选择劳动仲裁：

   • 当支付令因公司提出异议而失效后，您作为劳动者，有权选择向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，以解决与公司之间的劳动争议。
   • 劳动仲裁是解决劳动争议的一种法定方式，其裁决具有法律效力，双方当事人应当履行。若一方不履行，另一方可以向人民法院申请强制执行。

2. 仲裁前的准备：

   • 在申请劳动仲裁前，建议您收集并整理好与争议相关的证据材料，如劳动合同、工资单、工作记录等，以便在仲裁过程中证明自己的主张。
   • 同时，您也需要了解劳动仲裁的申请流程、仲裁时效等法律规定，以确保自己的权益得到充分保障。

3. 仲裁过程中的注意事项：

   • 在仲裁过程中，您应当遵守仲裁庭的纪律，如实陈述事实，提供证据，并尊重仲裁庭的裁决。
   • 若您对仲裁裁决不服，还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼，以进一步维护自己的权益。

三、可能的法律后果

• 如果您选择申请劳动仲裁，并成功获得了仲裁裁决，那么公司应当履行裁决内容。若公司不履行，您可以向人民法院申请强制执行。
• 如果您未选择申请劳动仲裁，或者仲裁裁决未支持您的主张，那么您可能需要考虑其他途径来维护自己的权益，如与公司协商、寻求调解等。但请注意，这些途径可能不如劳动仲裁具有法律强制力。

建议：在面对此类劳动争议时，建议您及时咨询专业律师（如我），以便更准确地了解自己的权益和可能的法律路径。同时，也请您保持冷静和理性，通过合法途径来维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。