在事实不清、证据不足的案件中，如果当事人不愿调解，案件并不会不了了之，而是会依据法定程序继续推进或作出相应处理。以下从不同角度进行详细分析：

一、刑事案件角度

在刑事案件中，如果事实不清、证据不足，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，检察院可能会作出不起诉决定，或者法院可能会判决无罪。但这并不意味着案件“不了了之”，而是法律对证据不足、事实不清情况下的法定处理方式。具体来说：

1. 检察院审查起诉阶段：如果检察院认为案件事实不清、证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。此时，案件在检察院阶段即告终结，但并非“不了了之”，而是法律对证据不足情况的明确处理。
2. 法院审判阶段：如果案件进入法院审判阶段，法院经审理认为事实不清、证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出无罪判决。这同样是对证据不足情况的法定处理，而非“不了了之”。

二、民事案件角度

在民事案件中，如果事实不清、证据不足，法院会根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，结合双方当事人的举证情况，对案件事实进行认定。如果确实无法查清事实，法院可能会根据举证责任分配原则，判决承担举证责任的一方承担不利后果。具体来说：

1. 举证责任分配：在民事诉讼中，举证责任通常遵循“谁主张，谁举证”的原则。如果一方当事人主张的事实无法得到充分证据支持，且该事实属于其应当举证的范围，那么法院可能会判决该方当事人承担不利后果。
2. 法院调查取证：在特定情况下，法院也可以依职权或依申请进行调查取证。但如果经过调查仍无法查清事实，法院将根据现有证据和法律规定作出判决。
3. 判决结果：在事实不清、证据不足的情况下，法院可能会判决驳回原告的诉讼请求，或者根据公平原则、诚实信用原则等作出其他适当判决。这同样是对证据不足情况的法定处理，而非“不了了之”。

三、行政案件角度

在行政案件中，如果事实不清、证据不足，法院会根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，对行政行为的合法性进行审查。如果行政行为缺乏事实依据或证据不足，法院可能会判决撤销或变更该行政行为。这同样是对证据不足情况的法定处理方式。

法律建议

1. 积极举证：在诉讼过程中，当事人应积极收集、提供证据，以支持自己的主张。如果证据不足，可能会面临不利后果。
2. 考虑调解：虽然调解不是强制性的，但在事实不清、证据不足的情况下，调解可能是一种更为妥善的解决方式。通过调解，双方可以达成妥协，避免诉讼风险。
3. 寻求专业帮助：如果当事人对法律程序或证据规则不熟悉，建议寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和诉讼策略，帮助当事人更好地维护自己的权益。

有问题可以直接向我咨询，我将结合你的具体情况，提供更详细的法律建议。