在事实不清、证据不足的情况下，检察院执意立案，法院最终的判决会因案件具体情况和证据补强情况的不同而有所差异，但总体来说，法院会遵循“以事实为依据，以法律为准绳”的原则进行判决。以下是对此问题的详细分析：
一、法院判决的基本原则
法院在审理案件时，会严格依据事实和法律进行判决。如果检察院提起公诉的案件事实不清、证据不足，法院在审理过程中会要求检察院补充证据或者进行进一步的调查。如果经过补充证据和调查后，仍然无法达到事实清楚、证据确实充分的证明标准，法院可能会作出无罪判决或者驳回起诉的决定。
二、可能的具体判决情况
无罪判决：
- 如果法院在审理过程中认为案件事实不清、证据不足，且无法通过补充证据或进一步调查来查明事实，那么法院可能会依据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，作出无罪判决。这意味着被告人将被宣告无罪，并立即释放（如果已被羁押）。
驳回起诉：
- 在某些情况下，如果法院认为检察院提起的公诉不符合起诉条件，例如证据不足、事实不清等，法院可能会裁定驳回起诉。这通常发生在案件审理的初期阶段，如果法院认为案件不具备继续审理的条件，就会作出这样的决定。
要求补充证据或进一步调查：
- 如果法院认为案件事实部分不清、证据部分不足，但认为通过补充证据或进一步调查有可能查明事实，那么法院可能会要求检察院在规定的时间内补充证据或者进行进一步的调查。如果检察院在规定时间内未能补充足够证据或调查结果仍无法支持起诉，法院可能会作出无罪判决或驳回起诉。
有罪判决（但这种情况较为罕见）：
- 在极少数情况下，即使案件事实部分不清、证据部分不足，但如果法院认为现有证据已经足以支持有罪判决，且被告人无法提出有效的无罪辩护，法院可能会作出有罪判决。然而，这种情况通常发生在证据虽然不完全充分，但已经形成了完整的证据链，且能够排除合理怀疑的情况下。
三、对当事人的建议
积极配合调查：
- 如果当事人被卷入此类案件，应积极配合司法机关的调查工作，提供有助于查明事实的证据和信息。
寻求专业法律帮助：
- 当事人可以聘请专业律师进行辩护，律师会根据案件具体情况和证据情况，为当事人提供专业的法律意见和辩护策略。
关注案件进展：
- 当事人应密切关注案件的进展情况，及时了解法院的判决结果和理由，以便在必要时采取进一步的法律行动。
最后需要强调的是，每个案件的具体情况都是独特的，法院的判决也会因案件事实和证据的不同而有所差异。因此，如果你或你身边的人遇到了类似的问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律分析和建议。