关于“内部联营施工协议是否可以收取保证金”的问题，我给出如下分析：
首先，明确结论：内部联营施工协议中是否可以收取保证金，并非一概而论，而是需要根据具体的协议内容、双方约定以及相关法律法规来综合判断。
接下来，详细分析：
协议性质与约定：
- 内部联营施工协议，本质上是一种合作或联营的协议，其核心在于双方共同承担施工任务，分享收益。
- 保证金通常作为一种担保或履约保证，用于确保合同一方能够按照约定履行其义务。
- 因此，如果协议中明确约定了收取保证金作为履约担保，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么收取保证金是合法的。
法律法规约束：
- 在建设工程领域，相关法律法规对于保证金的收取有严格的规定，主要是为了防止滥用保证金、保护施工企业的合法权益。
- 如果法律法规明确禁止或限制在某类合同中收取保证金，那么即使协议中有相关约定，也不能违反法律法规的强制性规定。
实际操作中的考量：
- 在实际操作中，是否收取保证金、收取多少保证金，都需要双方根据项目的具体情况、风险大小、合作信任度等因素进行协商确定。
- 同时，也需要考虑保证金的管理和使用方式，确保保证金的安全性和有效性。
综上所述：内部联营施工协议中是否可以收取保证金，需要综合考虑协议的性质、双方的约定以及相关法律法规的规定。如果协议中有明确且合法的约定，且不违反法律法规的强制性规定，那么收取保证金是可行的。但如果没有明确的约定或约定违反法律法规，则不能收取保证金。因此，在具体操作中，建议双方充分协商并明确约定保证金的相关事宜，以确保合同的合法性和有效性。