若不关联公司发工资的行为涉及劳动纠纷，法院会根据具体情况，判断双方是否存在事实劳动关系，并据此作出相应判决。以下从不同角度进行分析：

1. 若双方存在事实劳动关系

   • 核心判断：即使工资由不关联的公司发放，若劳动者实际上为另一家公司提供了劳动，且该公司对劳动者进行了管理、指挥和监督，双方形成了事实上的劳动关系，那么该公司应承担用人单位的法律责任。
   • 法律依据：根据《劳动和社会保障部关于确立劳动关系有关事项的通知》第一条，用人单位招用劳动者未订立书面劳动合同，但同时具备下列情形的，劳动关系成立：（一）用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格；（二）用人单位依法制定的各项劳动规章制度适用于劳动者，劳动者受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动；（三）劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分。
   • 判决结果：法院可能会判决该公司支付劳动者工资、加班费、经济补偿金等，并可能要求该公司为劳动者补缴社会保险费。

2. 若双方不存在事实劳动关系

   • 核心判断：如果劳动者与发放工资的公司之间不存在实际的劳动用工关系，且劳动者也未能证明其与另一家公司存在事实劳动关系，那么劳动者可能难以直接要求该公司承担用人单位的法律责任。
   • 特殊情况：然而，如果发放工资的公司与实际用工的公司之间存在关联关系（如母子公司、关联企业等），且劳动者能够证明其实际上是为关联企业中的某一公司提供了劳动，那么法院可能会根据实际情况，判决关联企业中的相关公司承担连带责任。
   • 判决结果：在不存在事实劳动关系且无关联关系的情况下，法院可能会驳回劳动者的诉讼请求。但在存在关联关系且劳动者能证明实际用工关系的情况下，法院可能会判决关联企业中的相关公司支付劳动者相应的劳动报酬和福利待遇。

3. 若涉及虚假发放工资或逃税等违法行为

   • 核心判断：如果发放工资的公司或实际用工的公司存在虚假发放工资、逃税等违法行为，那么这些行为不仅可能违反劳动法律法规，还可能触犯税收法律法规。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或者在帐簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税。对纳税人偷税的，由税务机关追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
   • 判决结果：在这种情况下，法院可能会将案件移送至税务机关或公安机关进行处理，并可能根据处理结果对涉案公司进行相应的行政处罚或刑事处罚。同时，劳动者也可能因此受到一定的牵连或影响，但具体责任需根据实际情况进行判断。

建议：如果您遇到了不关联公司发工资的情况，并因此产生了劳动纠纷或法律问题，建议您及时收集相关证据（如工资条、工作证、考勤记录等），以证明您与实际用工公司之间存在事实劳动关系。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。