结论前置：公司存在劳动纠纷时，法律上并未直接禁止其进行转让，但转让的合法性与可行性需综合考虑多方面因素，包括法律法规、劳动纠纷的性质和严重程度、转让合同中的约定以及潜在的法律风险等。
一、法律层面的转让合法性
根据《中华人民共和国公司法》等相关法律法规，公司作为一个独立的法人主体，其股权或资产的转让是常见的商业行为。只要满足《公司法》规定的转让条件和程序，如经过一定比例的股东同意、签订合法有效的转让协议、办理工商变更登记等，公司即可进行转让。因此，从法律层面看，存在劳动纠纷的公司是可以进行转让的。
二、劳动纠纷对公司转让的影响
责任承担：
- 公司转让后，劳动纠纷的责任依然由公司本身承担，不受转让影响。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十三条，用人单位变更名称、法定代表人、主要负责人或投资人等事项，不影响劳动合同的履行。这意味着，即使公司发生转让，原劳动合同继续有效，新公司主体需承继原公司的权利和义务，包括与劳动者之间的劳动关系及未解决的劳动纠纷。
- 若劳动纠纷产生于转让前，责任主体为公司，而非受让方股东个人。但公司所有权的变动可能涉及新老股东间的责任划分，双方可在转让协议中约定劳动纠纷的处理责任。
公司价值与价格：
- 劳动纠纷的性质和严重程度会直接影响公司的市场价值和转让价格。小额的工资或福利问题可能影响不大，但大规模的裁员、严重的违法用工行为或长期诉讼会显著降低公司的吸引力和价值。
- 潜在买家在购买公司时会进行全面的尽职调查，包括审查劳动关系状况。未解决的劳动纠纷可能导致买家要求降低购买价格或要求卖家在转让前解决问题。
法律法规限制：
- 在某些特定情况下，法律可能要求公司在转让前解决特定的劳动纠纷，如拖欠员工工资或未依法缴纳社会保险费等。这些要求旨在保护劳动者的合法权益，确保转让过程不会损害劳动者的利益。
三、转让过程中的关键考虑因素
合同约定：
- 转让合同中若明确禁止存在纠纷的公司进行转让，则需先解决纠纷再进行转让。因此，审查转让合同中的相关条款至关重要。
- 双方应在转让协议中明确劳动纠纷的处理方式和责任承担主体，以规避未来可能出现的法律风险。例如，可以约定由转让方负责解决转让前已存在的纠纷并承担费用，或双方按比例分担责任。但此约定仅对内部有约束力，不能对抗劳动者。
信息披露与协议约定：
- 转让方有义务向受让方如实披露公司存在的劳动纠纷情况，包括纠纷的起因、处理进展及可能的赔偿责任等。隐瞒信息可能导致违约责任。
- 受让方在收购公司时应进行全面的尽职调查，包括审查劳动关系状况，以评估潜在的法律风险和经济损失。
受让方风险：
- 受让方在收购公司时需全面了解目标公司的潜在法律风险，包括劳动纠纷。若受让方在知晓存在纠纷的情况下仍决定受让，可能需要承担由此带来的法律责任和经济损失。若不知情，可在承担责任后依据股权转让协议向转让方追偿。
四、综合建议
提前处理纠纷：
- 在考虑转让之前，建议公司尽量妥善处理好所有的劳动纠纷。这不仅可以提升公司的市场形象和价值，还能减少转让过程中的法律风险。例如，可以与劳动者协商解决纠纷，或通过法律途径解决争议。
明确合同条款：
- 在转让合同中详细约定劳动纠纷的处理方式和责任划分，确保双方权益得到保障。例如，可以约定纠纷解决的时间表、费用承担方式以及违约责任等。
寻求专业支持：
- 在进行公司转让前，建议咨询专业的律师团队，对转让过程中可能涉及的法律问题进行全面评估和指导。律师可以协助审查转让合同、提供法律意见并帮助处理劳动纠纷等事宜。
综上所述，公司存在劳动纠纷时并非不能进行转让，但需综合考虑多方面因素并确保转让过程的合法性和合规性。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律支持，请直接向我咨询。