结论：单位扣除绩效后员工辞职，是否需要支付补偿金，需根据具体情况判断，主要看单位扣除绩效是否合法合理。以下分情况详细说明：

一、单位扣除绩效合法合理的情况

如果单位扣除绩效是基于合法合理的规章制度，且这些规章制度已经过民主程序制定、公示或告知劳动者，同时扣除绩效的原因与劳动者的工作表现、业绩等直接相关，且扣除的绩效比例在合理范围内，那么这种扣除是合法的。在此情况下，员工因单位扣除绩效而辞职，通常不被视为单位违法解除劳动合同或未足额支付劳动报酬，因此员工要求单位支付经济补偿金的请求可能不会得到支持。

法律依据：

• 根据《劳动合同法》第三十八条，劳动者解除劳动合同的情形中，并未直接规定单位扣除绩效员工即可解除劳动合同并要求补偿，除非扣除绩效导致未及时足额支付劳动报酬且符合该条款其他情形。
• 单位规章制度若合法有效，且扣除绩效有明确依据，则员工辞职一般不触发经济补偿。

二、单位扣除绩效不合法合理的情况

如果单位扣除绩效没有合法合理的依据，或者扣除的比例过高，超出了正常范围，甚至存在恶意克扣的情况，那么这种扣除就是违法的。在此情况下，员工有权以单位未足额支付劳动报酬为由解除劳动合同，并要求单位支付经济补偿金。

法律依据及计算方式：

• 法律依据：根据《劳动合同法》第三十八条和第四十六条，单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同，并要求单位支付经济补偿金。
• 计算方式：经济补偿金按照劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

示例： 假设员工在单位工作了3年，月平均工资为5000元。因单位违法扣除绩效，员工提出辞职并要求经济补偿。那么，单位应支付的经济补偿金为：3年 × 5000元/年 = 15000元。

三、特殊情况说明

如果单位扣除绩效是因为员工存在严重违反规章制度、失职等过错行为，且这些行为给单位造成了重大损失，那么单位扣除绩效可能被视为合法的纪律处分。在此情况下，员工辞职一般不要求单位支付经济补偿金。但单位需确保扣除绩效的决策过程合法合规，且有充分证据证明员工的过错行为及损失情况。

建议：

• 对于员工而言，如果认为单位扣除绩效不合法合理，可以先与单位协商解决；协商不成，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 对于单位而言，应确保扣除绩效的决策过程合法合规，避免引发劳动争议和法律风险。

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