结论：已办在建工程抵押的企业在领到不动产权证后，是否需要做担保变更，取决于抵押合同的具体约定以及抵押登记的内容是否需要更新。若抵押合同或登记内容需因不动产权证的领取而调整，则应办理担保变更；若无需调整，则可能无需办理。以下从不同角度进行分析：
一、抵押合同与登记内容的关联性
抵押合同约定：
- 抵押合同是抵押权设立的基础，其中会明确抵押物的范围、抵押权的设立条件、抵押权的实现方式等。
- 若在建工程抵押合同中明确约定，在抵押物（即在建工程）转变为已建成的不动产（即领到不动产权证后）时，需要办理抵押变更登记或重新签订抵押合同，则企业应按照合同约定办理。
抵押登记内容：
- 抵押登记是抵押权设立的公示方式，具有对抗第三人的效力。
- 若在建工程抵押时，抵押登记的内容（如抵押物描述、抵押范围等）与领到不动产权证后的不动产状况存在差异，或者抵押登记中明确约定了需在抵押物状态变化时更新登记内容，则企业应办理担保变更登记。
二、法律规定的角度
- 根据《民法典》及相关法律法规，抵押权设立后，抵押财产发生变化的，抵押权人可以与抵押人协议变更抵押权顺位以及被担保的债权数额等内容。但是，抵押权的变更未经其他抵押权人书面同意的，不得对其他抵押权人产生不利影响。
- 若在建工程抵押转变为不动产抵押，虽然抵押物本质未变（仍为同一地块上的建筑物），但抵押物的状态（从在建到建成）和权利凭证（从无到有不动产权证）发生了变化。这种变化可能影响到抵押权的实现和公示效果，因此，从法律严谨性的角度出发，办理担保变更登记是更为稳妥的做法。
三、实际操作中的建议
审查抵押合同：
- 企业应首先审查在建工程抵押合同，明确合同中关于抵押物状态变化时的处理方式。
咨询抵押权人：
- 企业应与抵押权人（通常是银行或其他金融机构）沟通，了解其对于抵押物状态变化后的处理要求。
办理变更登记：
- 若抵押合同或抵押权人要求办理担保变更登记，企业应及时向不动产登记机构申请办理变更登记手续，以确保抵押权的合法有效和公示效果。
保留相关证据：
- 在办理变更登记过程中，企业应保留好相关证据（如变更登记申请书、抵押合同变更协议、不动产权证等），以备不时之需。
总结来说，已办在建工程抵押的企业在领到不动产权证后，是否需要做担保变更，需根据抵押合同的具体约定和抵押登记的内容来判断。若合同或登记内容有明确要求，或出于法律严谨性和抵押权保护的角度考虑，办理担保变更登记是更为稳妥的做法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。