员工挪用公款16万元属于严重的违法行为，可能同时涉及刑事责任和民事赔偿责任，具体处理方式需结合案件细节分情况讨论。以下从刑事和民事两个角度展开分析：
一、刑事责任层面：可能构成挪用资金罪或职务侵占罪
根据《刑法》第272条（挪用资金罪）和第271条（职务侵占罪），员工挪用公款16万元的处理需区分行为性质：
若员工挪用资金用于个人使用或借贷给他人，且未超过3个月未还，或虽未超过3个月但数额较大进行营利活动，或进行非法活动：
- 构成挪用资金罪，处三年以下有期徒刑或拘役；挪用本单位资金数额巨大的（通常指10万元以上），或数额较大不退还的（通常指5万元以上），处三年以上十年以下有期徒刑。
- 16万元已达到“数额较大”标准，若用于非法活动（如赌博、贩毒等），则直接构成犯罪，无需考虑时间限制；若用于营利活动或个人使用，需结合是否超过3个月未还判断。
若员工以非法占有为目的，将公款据为己有（如通过伪造单据、虚报费用等方式侵吞）：
- 构成职务侵占罪，处三年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金；数额巨大的（通常指100万元以上）或数额特别巨大的（通常指1500万元以上），处三年以上十年以下有期徒刑或无期徒刑，并处罚金。
- 16万元属于“数额较大”范围，但需注意：若员工在挪用后产生非法占有目的（如拒不归还且否认挪用事实），可能从挪用资金罪转化为职务侵占罪。
关键点：
- 需通过证据（如资金流向、员工供述、同事证言等）明确行为性质（是“暂时使用”还是“永久占有”）。
- 若员工主动退还全部款项并认罪认罚，可争取从轻或减轻处罚（如缓刑）。
二、民事责任层面：公司有权要求员工赔偿损失
无论员工是否被追究刑事责任，公司均可通过民事诉讼要求其赔偿全部经济损失：
- 赔偿范围：包括被挪用的16万元本金及因挪用行为导致的间接损失（如利息损失、业务机会损失等，但需公司举证）。
- 诉讼程序：公司可单独提起民事诉讼，或在刑事案件中提起附带民事诉讼（但实践中刑事附带民事诉讼通常仅支持直接物质损失，间接损失可能需另行起诉）。
- 执行问题：若员工无财产可供执行，公司可申请强制执行其工资、房产等财产，或要求其分期偿还。
建议行动步骤：
- 立即固定证据：保存资金流水、合同、员工签字文件等，证明挪用事实及金额。
- 报警并配合调查：向公安机关报案，推动刑事立案，同时通过刑事程序追缴赃款。
- 同步提起民事诉讼：若刑事追缴不足，通过民事诉讼补充赔偿。
- 完善内部管理：审查财务制度漏洞，避免类似事件再次发生。
温馨提示：具体案件需结合证据细节判断，如需进一步分析，可直接向我提供更多信息（如挪用用途、是否归还、员工职位等），我会为您制定更精准的应对方案。