结论前置：双方签订合同约定公司应支付员工的工伤待遇后，员工在特定情形下是可以反悔的。以下是对此问题的详细分析：
一、协议有效的情形及限制
有效条件：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》及相关法律规定，若工伤赔偿协议是在劳动者已认定工伤和评定伤残等级的前提下签订，且不存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形，该协议通常具有法律效力。双方应依约履行各自义务。
- 显失公平的限制：即使协议内容存在显失公平的情况（如赔偿金额明显低于法定标准），只要协议签订过程合法合规，且未通过专业法律程序进行认定，法院一般仍会认可其效力。但需注意，此处的“显失公平”需通过法律途径进行确认。
不能反悔的情形：
- 如果协议是在平等、自愿、协商一致的基础上签订的，且不存在上述可撤销的情形，同时协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益，那么该协议是合法有效的。双方都应当按照协议履行各自的义务，一般情况下员工不可以反悔。
二、可以反悔的情形
重大误解或显失公平：
- 若协议签订时存在对工伤性质、赔偿标准的重大误解，或赔偿数额明显偏离法定标准（如低于当地最低工资标准对应的赔偿比例），员工可依据《民法典》第一百四十七条请求撤销协议。例如，职工因不了解伤残等级对应的赔偿标准而接受过低补偿，即构成重大误解。
- 若一方利用优势地位或对方缺乏经验，使双方的权利与义务明显违反公平、等价有偿原则，协议可能被视为显失公平。员工可请求变更或撤销该协议。
欺诈、胁迫或乘人之危：
- 用人单位通过虚构事实隐瞒真相（如谎称“不签协议就不发工资”）、暴力威胁或利用职工急需医疗费的困境迫使签约的行为无效。此类情形下签订的协议自始不具有约束力，员工有权请求撤销。
未进行工伤认定和劳动能力鉴定：
- 在未完成工伤认定和伤残等级鉴定前签订的协议可能被认定为无效。例如，职工在未确定伤残等级时就赔偿数额达成一致，后续发现实际伤残程度远超预期，可主张协议无效并重新协商。
违反法律法规强制性规定：
- 协议内容若免除用人单位依法应承担的工伤保险责任（如约定“一次性了结后不再承担任何费用”却排除后续治疗费），则该条款无效。但不影响其他合法条款的效力。
三、反悔的法律后果
- 协议撤销/变更：通过诉讼或仲裁确认协议无效后，员工可要求按法定标准重新核算赔偿金额。此时需提供证据证明存在上述可撤销情形。
- 时效限制：行使撤销权需在知道或应当知道撤销事由之日起一年内提出，超过期限则丧失胜诉权。
四、建议与注意事项
- 签订协议前：员工应充分了解自己的权益和法律规定，避免在不知情或受胁迫的情况下签订协议。如有疑问，可咨询专业律师。
- 签订协议时：确保协议内容明确具体，包括赔偿项目、金额、支付方式等，并建议由专业律师审核条款合法性。
- 发现协议问题后：应及时固定证据，通过劳动仲裁或诉讼途径维护权益。特别注意显失公平和重大误解情形的举证责任，需提供充分证据证明协议签订时的客观情况。
总结：工伤保险待遇协议的效力取决于其签订过程中的合法性、公正性以及内容的合理性。员工在签订协议前应充分了解自己的权益和法律规定，避免在不知情或受胁迫的情况下签订协议。如认为自己在签订协议时受到了不公正的对待或协议内容不合理，应及时咨询我并通过法律途径维护自己的权益。