若在行政案件办理过程中遇到领导介入阻挡，可采取以下措施维护合法权益与程序公正：

1. 明确法律程序与职责边界
   根据《行政诉讼法》及《公务员法》相关规定，行政案件的办理应遵循法定程序，行政机关及其工作人员不得干预、阻碍司法活动或案件调查。若领导以行政指令、内部文件等形式要求停止调查、修改证据或影响判决结果，属于违法行为，办案人员有权拒绝执行并向上级机关或监察部门报告。

2. 内部举报与监督机制

   • 向上级机关反映：若领导干预行为涉及本单位内部，可向上一级行政机关或同级政府法制部门提交书面材料，说明干预事实、法律依据及对案件的影响，要求上级介入调查。
     
   • 启动监察程序：根据《监察法》，若领导行为涉嫌滥用职权、玩忽职守或徇私枉法，可向监察委员会实名举报，提供证据材料（如书面指令、录音、聊天记录等），要求立案调查。

3. 司法救济途径

   • 申请法院介入：若干预行为已实际影响案件办理（如证据被篡改、程序被非法终止），可向受理案件的法院提交《排除非法证据申请书》或《程序违法异议书》，要求法院依职权调查干预事实，并裁定排除非法证据或纠正程序违法。
     
   • 提起行政诉讼：若干预行为导致案件结果不公，可在行政诉讼中以“行政行为违法”为由，将干预的领导或单位列为第三人，要求法院撤销原行政行为并责令重新作出合法决定。

4. 证据固定与风险防范

   • 全程留痕：对领导干预的指令、会议记录、沟通内容等，通过书面、录音、录像等方式固定证据，避免口头指令无据可查。
     
   • 匿名举报保护：若担心报复，可依据《监察法》第64条，通过监察委员会的匿名举报渠道提交线索，监察机关需对举报人信息严格保密。
     
   • 联合办案支持：若案件涉及重大公共利益，可联合其他办案人员（如检察官、律师）共同向司法机关或媒体披露干预事实，形成社会监督压力。

5. 法律责任追究

   • 行政责任：干预案件的领导可能面临警告、记过、降级、撤职等处分（《公务员法》第59条）。
     
   • 刑事责任：若干预行为构成《刑法》第397条“滥用职权罪”或第399条“徇私枉法罪”，可依法追究刑事责任，最高可处十年以上有期徒刑。

行动建议：

1. 优先通过内部举报与监察程序解决，降低直接对抗风险；
   
2. 若内部渠道无效，立即启动司法救济，向法院提交书面异议；
   
3. 全程保持证据完整性，避免因证据缺失导致维权失败。
   

如有具体案件细节或证据材料，可进一步向我咨询，我将结合案情提供针对性法律方案。