在处理居间合同纠纷中，若发现居间人实际上是合同一方的实际管理人，并借居间名义收取好处，这通常涉及复杂的法律关系和潜在的违法行为。以下是对此情况的处理建议：

1. 明确法律关系：

   • 首先，需明确居间合同与实际管理关系之间的界限。居间合同是居间人向委托人报告订立合同的机会或者提供订立合同的媒介服务，委托人支付报酬的合同。若居间人实为合同一方的实际管理人，则可能违反了居间合同的本质，构成了双方代理或自我交易等违法情形。

2. 分析合同效力：

   • 根据《民法典》的相关规定，若居间人作为合同一方的实际管理人，借居间名义收取好处，可能导致合同存在效力瑕疵，如欺诈、胁迫或显失公平等。需结合具体案情，分析合同是否可撤销或无效。

3. 追究法律责任：

   • 若居间人的行为构成违法，如欺诈、不当得利等，可依法追究其民事责任，要求返还收取的好处费，并赔偿因此造成的损失。同时，若其行为触犯刑法，如构成诈骗罪、职务侵占罪等，还应依法追究其刑事责任。

4. 收集证据并起诉：

   • 受害人应积极收集相关证据，如合同文本、转账记录、通信记录等，以证明居间人的实际管理身份及其借居间名义收取好处的事实。随后，可向人民法院提起诉讼，要求维护自身合法权益。

5. 预防与规避：

   • 为避免此类纠纷，建议在签订居间合同时，对居间人的身份、职责、权限等进行明确约定，并加强对合同履行的监督。同时，提高法律意识，警惕借居间名义进行的违法活动。

综上所述，处理此类居间合同纠纷需从明确法律关系、分析合同效力、追究法律责任、收集证据并起诉以及预防与规避等多个角度进行综合考虑。若您面临此类问题，建议及时咨询专业律师，以获取针对性的法律帮助。