针对租客打官司涉及厂房连在一起，一边有证一边没证的情况，判决结果将取决于多个因素，以下是对此问题的详细分析：

1. 有证厂房的判决：

   • 对于有合法产权证书的厂房部分，法院通常会依据产权证书来确认其权属和合法性。如果租客与房东之间就这部分厂房存在租赁纠纷，法院将根据租赁合同的内容、双方的实际履行情况以及相关法律法规进行判决。
   • 如果租客违反了租赁合同中的条款，如未按时支付租金、擅自改变厂房用途等，房东有权要求租客承担违约责任，甚至可能解除租赁合同。

2. 无证厂房的判决：

   • 对于没有合法产权证书的厂房部分，情况将更为复杂。首先，需要确认这部分厂房的建设是否符合相关法律法规，如是否经过规划审批、是否属于违章建筑等。
   • 如果无证厂房属于违章建筑，那么其租赁合同可能被视为无效。在这种情况下，租客可能无法依据租赁合同来主张自己的权益，而房东也可能面临行政处罚。
   • 如果无证厂房虽然未取得产权证书，但建设时符合相关法律法规，且未对他人造成损害，那么法院在判决时可能会考虑双方的实际使用情况、租赁合同的履行情况以及公平原则等因素。

3. 综合判决：

   • 在实际判决中，法院会综合考虑有证厂房和无证厂房的情况，以及双方的实际争议点。如果租客与房东之间的纠纷主要涉及有证厂房部分，那么法院可能会主要依据这部分厂房的产权证书和租赁合同进行判决。
   • 如果纠纷同时涉及有证和无证厂房部分，法院则需要更加谨慎地分析双方的权利义务关系，以及无证厂房对判决结果可能产生的影响。

4. 建议：

   • 对于租客而言，在签订租赁合同前应仔细审查厂房的产权证书和相关法律法规，确保租赁的厂房合法合规。
   • 如果在租赁过程中发现厂房存在无证或违章建筑的情况，应及时与房东沟通并寻求解决方案，必要时可以咨询专业律师以维护自己的合法权益。

总之，针对租客打官司涉及厂房连在一起，一边有证一边没证的情况，判决结果将取决于多个因素。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。