针对事业干部长期不上班的情况，单位应依据相关法律法规及规章制度，结合员工的具体情况进行妥善处理，具体如下：
一、处理原则与前提
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。对于事业单位工作人员，同样适用此原则，特别是连续旷工超过规定天数的情形。
- 同时，需参照《事业单位工作人员管理条例》等相关规定，确保处理措施的合法性与合规性。
程序合法性：
- 在采取任何处理措施前，单位必须确保程序的合法性，包括向员工发出书面通知，要求其解释缺勤原因，并给予合理期限进行改正。
二、旷工情形的具体处理
在编人员长期不上班：
- 认定：未经请假或请假未获批准而擅自离岗，视为旷工。
- 初期措施：对初次或短期旷工者，进行批评教育，并口头或书面告诫，要求改正。
- 纪律处分：连续旷工超过15个工作日，或者1年内累计旷工超过30个工作日的，给予政务处分，并解除聘用合同。
非在编人员（如合同制员工）长期不上班：
- 按单位规章制度处罚：根据单位制定的考勤及请假制度，对长期不上班的员工进行处罚。
- 解除劳动合同：达到严重违反单位规章制度程度的，事业单位可以单方面解除劳动合同。
三、特殊情况的处理
涉嫌违法犯罪：
- 若员工因涉嫌违法犯罪被限制人身自由，单位需待司法机关最终处理结果后决定后续处理方式。有罪并受刑事处罚者，一般予以开除。
因病或其他特殊原因：
- 员工因患病等特殊原因无法上班，应按单位规定办理请假手续并提供相应证明。经批准后，按病假等相关规定处理；未经批准或手续不全者，仍按旷工处理。
- 对于长期因病无法工作的员工，单位应依据国家相关规定，确定其医疗期，并在医疗期内保障其基本权益，如支付病假工资等。
四、其他管理措施
沟通协商：
- 与员工进行沟通，了解其不上班的具体原因和困难，尝试通过协商解决问题。例如，对于因家庭原因需要照顾的员工，单位可以考虑调整其工作岗位或工作时间。
提供帮助：
- 对于存在特殊情况需要单位照顾或支持的员工，单位可在合法合规前提下提供相应帮助。如提供心理咨询、协助解决家庭问题等。
加强制度建设：
- 加强规章制度的学习和宣传，提高员工对规章制度的认识和遵守意识。通过定期培训、考核等方式，确保员工了解并遵守单位的考勤及请假制度。
总结与建议：
事业单位在处理长期不上班的员工时，应严格遵循法律法规和单位规章制度，确保处理措施的合法性与合规性。同时，兼顾员工的实际情况和合理需求，通过沟通协商、提供帮助等方式，尝试解决问题。对于严重违反规章制度的员工，应依法依规进行纪律处分或解除劳动合同。在整个处理过程中，单位应保持与员工的良好沟通，确保处理的公正性和有效性。
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