加班双倍工资的诉讼时效适用普通时效，即三年，但在劳动争议中，需先经过仲裁前置程序，且仲裁时效为一年。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据
- 《中华人民共和国民法典》第一百八十八条：规定向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。这是加班双倍工资诉讼时效适用普通时效的法律依据。
- 《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条：规定劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这是劳动争议中仲裁时效的法律依据。
二、加班双倍工资的性质与诉讼时效
加班双倍工资是用人单位在特定情况下（如安排劳动者加班且未支付加班费）向劳动者支付的额外报酬，它属于劳动报酬的范畴。然而，在探讨其诉讼时效时，我们需明确的是，虽然它属于劳动报酬，但诉讼时效的适用仍需遵循《中华人民共和国民法典》中关于普通时效的规定，即三年。不过，在劳动争议中，劳动者需先经过仲裁前置程序，且仲裁时效为一年，这是劳动争议处理的特殊规定。
三、仲裁时效的起算点
劳动关系存续期间：
- 如果劳动者在劳动关系存续期间发现用人单位未支付加班费，其仲裁时效的起算点可能因具体情况而有所不同。一般来说，劳动者应在知道或应当知道权利受到侵害之日起一年内提出仲裁请求。但需注意，如果劳动者在劳动关系存续期间持续主张权利，或用人单位持续未支付加班费，仲裁时效可能会因中断或中止而重新计算或延长。
劳动关系终止：
- 如果劳动关系已经终止，劳动者应自劳动关系终止之日起一年内提出加班双倍工资的仲裁请求。这是因为劳动关系终止后，劳动者的权利受到侵害的状态得以明确，此时开始计算仲裁时效更为合理。
四、实际操作建议
鉴于加班双倍工资诉讼时效及仲裁时效的规定，劳动者在维护自身权益时应特别注意以下几点：
- 及时了解并保留相关证据：如考勤记录、工资单、加班通知等，以证明用人单位的违法行为。
- 在规定的时效期内提出仲裁或诉讼请求：避免因超过时效而丧失法律保护。如果劳动关系仍在存续，且用人单位持续未支付加班费，劳动者应定期向用人单位主张权利，以中断仲裁时效。
- 如对具体时效计算存在疑问：建议直接向我咨询，以确保自身权益得到充分保障。
综上所述，加班双倍工资的诉讼时效适用普通时效（三年），但在劳动争议中需先经过仲裁前置程序，且仲裁时效为一年。劳动者在维护自身权益时，应特别注意时效问题，并在必要时寻求法律帮助。