休息日加班工资的追索确实存在特殊时效问题，这主要涉及到劳动争议的仲裁时效规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般劳动争议的仲裁时效
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这是处理大多数劳动争议案件时适用的基本时效规定。
二、休息日加班工资追索的特殊时效
时效起算点：
- 对于休息日加班工资的追索，时效的起算点通常是从劳动者知道或应当知道其加班工资被拖欠或未足额支付之日起计算。然而，由于加班工资的支付往往与工资支付周期相关联，且劳动者可能因各种原因（如未及时核对工资条、未意识到权利被侵害等）而延迟发现加班工资问题，因此在实际操作中，时效的起算点可能存在一定的灵活性。
特殊情形下的时效延长：
- 如果劳动者在劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬（包括加班工资）发生争议，且用人单位书面承诺支付但未履行，或者劳动者向有关部门请求权利救济而用人单位同意履行等情形下，仲裁时效可以中断并重新计算。
- 另外，如果劳动关系终止，劳动者应当自劳动关系终止之日起一年内提出加班工资的追索请求。这是针对劳动关系终止后加班工资追索的特殊时效规定。
三、实际操作中的建议
及时主张权利：
- 劳动者在发现加班工资被拖欠或未足额支付后，应尽快与用人单位协商解决或向相关部门投诉举报，以避免超过仲裁时效而丧失追索权利。
保留证据：
- 劳动者应妥善保留与加班相关的证据，如加班记录、工资条、考勤表等，以便在需要时证明自己的加班事实和加班工资被拖欠的情况。
咨询专业律师：
- 如果劳动者对加班工资的追索存在疑问或遇到困难，可以及时向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。
四、法律后果
- 如果劳动者未能在规定的时效期间内提出加班工资的追索请求，且无法证明存在时效中断或延长的情形，那么其追索权利可能会因超过时效而丧失。这意味着劳动者将无法通过法律途径追回被拖欠的加班工资。
总结来说，休息日加班工资的追索确实存在特殊时效问题。劳动者应了解并遵守相关时效规定，及时主张自己的权利，并保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。