结论：超时36小时是否包含公休日加班，这主要取决于具体的加班时间安排以及法律法规或公司规章制度的具体规定。一般情况下，如果公休日被安排加班，则这36小时中可能包含公休日的加班时间。以下是对此问题的详细分析：
一、加班时间的计算
加班时间通常指的是员工在正常工作时间之外，按照公司或法律的要求继续工作的时间。这包括工作日延长的工作时间以及公休日、法定节假日的加班时间。因此，在计算超时36小时是否包含公休日加班时，首先要明确这36小时是如何构成的。
二、公休日加班的认定
公休日的定义：公休日通常指的是周末，即周六和周日。但具体是否包含其他休息日，如调休日等，需根据公司的规章制度或相关法律法规来确定。
公休日加班的认定标准：如果员工在公休日被安排工作，且该工作并非出于员工自愿（如调休、补班等情形下的工作），且公司未按照法律规定支付加班费或安排补休，则该时间应被认定为公休日加班。
三、超时36小时与公休日加班的关系
如果36小时中包含公休日加班：这意味着员工在公休日被安排了工作，且这部分时间被计入了超时工作的总时长中。在这种情况下，公司应按照法律规定支付公休日加班费或安排补休。
如果36小时中不包含公休日加班：这可能意味着员工的超时工作全部发生在工作日，或者虽然发生在公休日但公司已经通过调休等方式进行了补偿，因此这部分时间未被计入超时工作的总时长中。但这种情况较为少见，因为通常公休日的加班时间会被明确计入总加班时长。
四、法律法规依据
根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，员工在公休日加班的，公司应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；如果公休日加班后安排了补休，则可以不支付加班费。因此，在判断超时36小时是否包含公休日加班时，应参考这一法律规定，并结合公司的具体规章制度来进行分析。
五、建议
查阅公司规章制度：员工应首先查阅公司的规章制度，了解公司对于加班时间的计算方式以及公休日加班的认定标准。
与公司沟通：如果员工对于加班时间的计算或公休日加班的认定存在疑问，可以与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，以明确具体情况。
保留证据：员工应保留好与加班相关的证据，如加班通知、考勤记录等，以便在需要时维护自己的合法权益。
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