在法人不在的情况下，使用公章是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：
一、合法使用公章的情形
有合法授权：
- 如果法人（即法定代表人）已经明确授权给其他人员（如公司高管、部门负责人等）在特定事项上使用公章，并且该授权行为符合公司章程和内部管理规定，那么在该授权范围内使用公章是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体可以通过代理人实施民事法律行为。在法人授权范围内，代理人（即被授权使用公章的人员）的行为视为法人的行为，其法律后果由法人承担。
符合公司章程和内部管理规定：
- 即使法人没有直接授权，但如果公司章程或内部管理规定中明确规定了在某些情况下可以由特定人员使用公章，并且该使用行为符合这些规定，那么也是合法的。
- 实际操作建议：公司应制定明确的公章使用管理制度，规定公章的保管、使用、审批等流程，以确保公章使用的合法性和安全性。
二、违法使用公章的情形
无合法授权擅自使用：
- 如果未经法人授权或违反公司章程和内部管理规定，擅自使用公章进行民事活动，如签订合同、出具证明等，那么这种行为是违法的。
- 法律后果：擅自使用公章可能构成无权代理或表见代理，给公司造成损失的，公司有权要求行为人承担赔偿责任。同时，如果行为人利用公章进行违法犯罪活动，还可能面临刑事责任。
公章被盗用或滥用：
- 如果公章被盗用或滥用，如被他人非法获取并用于签订虚假合同、出具虚假证明等，那么这种行为也是违法的。
- 应对措施：一旦发现公章被盗用或滥用，公司应立即报警并采取措施防止损失扩大。同时，公司还可以向相关当事人追究法律责任，要求其赔偿损失。
三、特殊情况下的公章使用
法人代表变更但未办理变更登记：
- 如果法人代表已经变更但尚未办理变更登记手续，此时原法人代表仍然具有法定代表人的身份和职权。但是，如果原法人代表在此期间擅自使用公章进行民事活动，并且该活动与其职务无关或损害公司利益，那么这种行为可能构成违法。
- 建议：在法人代表变更后，公司应及时办理变更登记手续，并明确告知相关当事人新法人代表的身份和职权，以避免不必要的法律纠纷。
紧急情况下的公章使用：
- 在某些紧急情况下，如法人代表因故无法履行职责且无法及时授权他人使用公章时，为了维护公司的利益和正常运营，可以由公司其他高管或部门负责人根据内部管理规定使用公章。但是，这种使用行为应当事后及时向法人代表报告并获得其认可。
总结与建议：
- 在法人不在的情况下使用公章是否违法，取决于是否有合法授权、是否符合公司章程和内部管理规定以及是否存在盗用或滥用等情形。
- 为了确保公章使用的合法性和安全性，公司应制定明确的公章使用管理制度，并加强对公章的保管和监管。
- 如果您在公章使用方面遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。