结论：在法人不知情的情况下公章被使用，其责任归属及是否违法需根据具体情况判断，包括是否构成表见代理、是否存在恶意使用、是否在公司正常业务流程中的授权使用等。以下是对此问题的详细分析：
一、民事责任角度
表见代理情形：
- 适用情形：若行为人持有公司公章，且相对人有合理理由相信其有代理权（如持有盖有公章的空白合同、工作证等），则构成表见代理。
- 责任承担：根据《中华人民共和国民法典》第一百七十二条，公司需承担相应法律后果，并有权向无权使用公章的行为人追偿。这意味着，即使法人不知情，公司也可能因表见代理而对外承担责任。
无权代理情形：
- 适用情形：若行为人未经公司授权使用公章，且相对人应知或已知行为人无代理权（如明知行为人偷拿公章盖章），则构成无权代理。
- 责任承担：根据《中华人民共和国民法典》第一百七十一条，公司一般不承担责任，由行为人自行承担不良后果。相对人有过错的，按过错程度分担责任。在此情况下，法人不知情且未授权，公司通常不承担责任。
法人管理疏忽：
- 特殊考虑：即便法人对公章使用不知情，若法院或相关机构认定法人在公章管理上存在疏忽（如未妥善保管、未及时发现并制止滥用），法人也可能基于过错原则承担一定责任。这要求法人对公章管理尽到合理的注意义务。
二、刑事责任角度
恶意使用公章：
- 适用情形：若使用公章的人出于非法目的，如伪造文件、进行诈骗等违法犯罪活动，这种行为显然是违法的。
- 责任承担：根据相关法律法规，此类行为不仅可能导致民事赔偿责任，还可能面临刑事处罚。法人若不知情且未参与，通常不需承担刑事责任，但需配合司法机关调查。
法人参与或授意：
- 特殊考虑：如果法人对公章管理疏忽，为犯罪行为提供了便利，或事后知晓却未采取措施制止，甚至实际参与了利用公章的犯罪行为，则需承担相应的刑事责任。这体现了法律对犯罪行为的严惩不贷。
三、公司内部管理建议
加强公章管理：
- 公司应建立健全公章管理制度，明确公章的使用权限和审批流程，加强对公章的保管和监控。例如，可以设立专门的公章保管人员，对公章的使用进行登记和审批。
提高员工法律意识：
- 公司应加强对员工的法律教育和培训，提高员工的法律意识和风险意识，防止类似事件再次发生。例如，可以定期组织法律培训活动，让员工了解公章管理的重要性和相关法律规定。
及时采取措施：
- 发现公章被擅自使用后，公司应立即向公安机关报案、书面通知相对人等，以维护合法权益。例如，可以及时向公安机关提供线索，协助公安机关调查取证。
举例说明：
- 假设某公司员工未经法人授权，擅自使用公章与第三方签订了一份合同。若第三方有合理理由相信该员工有代理权（如该员工持有盖有公章的空白合同），则构成表见代理，公司需承担合同责任。
- 若该员工明知自己无代理权，仍擅自使用公章签订合同，且第三方应知或已知该员工无代理权，则构成无权代理，公司一般不承担责任，由该员工自行承担后果。
- 若该员工使用公章进行诈骗活动，则构成违法犯罪行为，需承担刑事责任。若法人对此不知情且未参与，通常不需承担刑事责任，但需配合司法机关调查。
总结与建议：
在法人不知情的情况下公章被使用，其责任归属及是否违法需根据具体情况判断。公司应加强公章管理，提高员工法律意识，及时采取措施维护合法权益。若遇到复杂情况或需要进一步法律帮助，请直接向我咨询。