结论：在法人允许的情况下刻公章，并不意味着该行为一定合法，其合法性取决于是否遵循了公司内部决策流程、获得了必要授权，并通过正规渠道按照法定程序刻制。
一、合法刻制公章的情形
遵循正规程序：
- 当法人代表按照公司内部的决策流程，经过必要的授权和审批后，前往公安机关指定的正规刻章单位，依据法定手续刻制公司章时，此行为是合法合规的。这是公司在正常经营活动中设立、变更印章的常见且被允许的操作。
- 具体流程：企业应首先准备上级主管部门出具的刻制证明和单位成立的批准文本，或者工商行政管理部门核发的营业执照等有效证件。持上述证件到所在地县级以上公安机关办理准刻手续，提交相关材料并填写申请表。公安机关在审核通过后，会开具《刻制印章通知单》或介绍信等证明文件。企业凭此证明文件到公安机关指定的合法印章制作单位进行公章的刻制。
获得明确授权：
- 法人允许刻制公章，必须是以公司名义，并经过公司合法决策程序（如董事会决议、股东会决议等）的明确授权。这种授权应当是书面形式的，并明确刻制公章的具体事项、范围、期限等。
二、违法刻制公章的情形
未经授权私自刻章：
- 即便法人允许，但如果未经公司合法决策程序，擅自刻制公司章，特别是出于不正当目的（如合同诈骗、伪造文件骗取利益等），则构成违法行为，甚至可能触犯刑法。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百八十条第二款，伪造公司印章的行为将受到刑事处罚。
在非正规渠道刻章：
- 即使法人有刻章的需求，并获得了某种形式的“允许”，但若未按规定到公安机关指定的地点刻章，而是通过非法途径私自刻制，同样属于违法行为。
- 法律依据：根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第五十二条，伪造、变造或者买卖企业印章的，将受到拘留和罚款的处罚。
三、法律后果与风险
- 公章无效：私自刻制的公章在法律上不具有任何效力，无法用于企业的正式文件和合同签署。
- 法律责任：私自刻章可能触犯《治安管理处罚法》和《刑法》，导致拘留、罚款甚至刑事责任的追究。
- 商业风险：使用私自刻制的公章可能导致合同无效、商业纠纷甚至法律诉讼，严重损害企业的声誉和经济利益。
四、建议与总结
- 严格遵循正规程序：公司法人或相关负责人应严格按照规定的程序，到本单位所在地县级以上公安机关治安管理部门办理审批手续，并前往专业部门刻章，以确保公司印章的合法性和安全性。
- 加强印章管理：公章的保管、交接和使用都应遵循严格的规章制度。公司应设立专门的印章管理岗位，负责印章的保管、使用和登记等工作，确保印章的安全和完整。
- 谨慎授权：法人允许刻制公章时，必须确保获得公司合法决策程序的明确授权，并保留好相关书面证据。
温馨提示：如果您在公章刻制或管理方面遇到任何法律问题，或者需要进一步的法律咨询，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。