入职两家公司是否能被查出来，取决于多种因素的综合作用，包括公司的背景调查力度、法律法规的监管要求、技术手段的应用以及员工自身行为的隐蔽性等。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司常规背景调查角度
可能查出来的情况：
- 专业机构调查：若新公司委托专业的背景调查机构进行全面调查，这些机构通常拥有广泛的信息渠道和先进的调查手段，如查询社保缴纳记录、公积金缴存记录、银行工资流水等，从而可能发现员工在其他公司就职的情况。
- 行业内信息交流：在某些行业（如金融、互联网），公司间可能存在信息交流机制，用于共享员工信息以规避风险。若两家公司属于同一行业且存在此类交流，员工兼职行为可能被揭露。
- 人际关系和工作履历调查：背景调查过程中，调查机构或人力资源部门可能会联系员工的前雇主、同事等证明人，了解员工的工作经历。若员工在另一家公司的工作情况被提及，也可能导致兼职行为被发现。
不容易查出来的情况：
- 调查不严格：部分公司对新员工的背景调查较为宽松，仅进行基本的身份验证和学历核实，不涉及深入的工作经历调查，此时员工兼职较不易被发现。
- 信息渠道有限：若员工在另一家公司的工作经历短暂或信息管理不规范，可能导致背景调查机构难以获取完整信息，从而无法发现兼职情况。
二、法律法规和监管要求角度
社保和税务监管：
- 根据我国法律，用人单位需为员工缴纳社保并代扣个税。若员工同时在两家公司任职并领取工资，理论上两家公司都应为其缴纳社保和代扣个税。然而，由于地区间社保和税务系统的联网程度和数据共享机制差异，可能并不会及时发现所有异常情况。但长期来看，重复参保和纳税申报异常仍有可能被察觉。
劳动法律法规约束：
- 《劳动合同法》规定，若员工同时与其他用人单位建立劳动关系并对完成本单位工作任务造成严重影响，或经用人单位提出后拒不改正，用人单位有权解除劳动合同。但需注意的是，公司需有充分证据证明员工行为对工作造成了严重影响。
- 同时，《劳动合同法》并未明确禁止员工在两家公司兼职，前提是工作内容、时间等不产生冲突且不影响本职工作。若因兼职给原用人单位造成损失，员工需承担赔偿责任。
特定行业和职位限制：
- 某些特定行业或职位（如公务员、竞业限制人员）可能有明确的法律规定不得兼职或需在特定条件下才可兼职。员工在考虑兼职时应特别注意相关法律法规的限制。
三、公司管理角度和技术手段分析
公司管理制度：
- 公司通常会在员工入职时要求提供离职证明、社保缴纳记录等材料以确认劳动关系解除情况。若员工隐瞒兼职情况，这些材料可能无法完全反映其真实就业状态。此外，公司内部的举报机制也可能导致兼职行为被揭露。
技术手段应用：
- 随着信息技术的发展，部分企业利用大数据、人工智能等技术手段监测和分析员工工作行为和数据，从而可能发现潜在的兼职情况。但这种做法需考虑技术投入和合规性问题。
四、实际情况的复杂性
在实际操作中，员工是否能在两家公司同时入职并工作还受到诸多因素的影响，如工作时间安排、工作任务量、公司文化和管理制度等。若两家公司的工作内容和时间安排存在冲突或其中一家公司明确要求员工不得兼职，则员工兼职行为面临被发现的风险较高。
法律建议：
- 员工在考虑兼职时，应充分了解相关法律法规和公司政策，确保自己的行为合法合规。
- 若决定兼职，应妥善安排工作时间和任务量，避免对两家公司的工作造成负面影响。
- 如有任何疑问或担忧，建议及时咨询专业律师以获取法律指导。
员工在考虑兼职时应谨慎行事，并确保自己的行为符合规定和要求以避免潜在的法律风险和职业风险。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。