核心结论：聘用人员收取5000元好处费的行为可能涉及违法或违规，需根据具体性质采取不同处理措施，包括内部追责、民事追偿、行政处罚或刑事追责。以下是具体分析：

1. 明确行为性质：是否构成违法或违规

• 商业贿赂：若好处费与业务合作、项目承接等直接相关，可能违反《反不正当竞争法》第九条，构成商业贿赂。此时需向市场监管部门举报，由其调查并处罚（如没收违法所得、罚款）。
• 职务侵占/贪污：若聘用人员利用职务便利，将单位财物非法占为己有（如通过好处费变相侵占），可能涉嫌《刑法》第二百七十一条（职务侵占罪）或第三百八十二条（贪污罪，需具备国家工作人员身份）。此时应立即向公安机关报案。
• 非国家工作人员受贿：若聘用人员为非国家工作人员，利用职务便利索取或收受他人财物，可能涉嫌《刑法》第一百六十三条（非国家工作人员受贿罪）。同样需报警处理。
• 内部违规：若行为未达到刑事立案标准，但违反公司规章制度（如廉洁协议），可依据内部规定追责（如解除劳动合同、追偿损失）。

2. 处理步骤：分情况应对

• 步骤一：固定证据
  收集转账记录、聊天记录、证人证言等，证明好处费的存在及与职务行为的关联性。证据需符合《民事诉讼法》第六十六条要求（如原件、合法来源）。
• 步骤二：内部处理
  若属内部违规，按公司制度处理（如警告、辞退），并要求返还好处费。若员工拒不配合，可提起民事诉讼，依据《民法典》第一百二十二条（不当得利）追偿。
• 步骤三：行政/刑事举报
  若涉嫌违法犯罪，向市场监管部门（商业贿赂）或公安机关（职务侵占/受贿）举报，并配合调查。
• 步骤四：民事追偿
  无论是否追究刑事责任，均可单独提起民事诉讼，要求返还好处费并赔偿损失（如因贿赂导致的合同违约损失）。

3. 风险提示：避免二次违法

• 处理过程中需严格依法取证，避免采取非法手段（如威胁、窃听），否则可能涉嫌侵犯公民个人信息罪等。
• 若公司未建立合规制度，可能面临“未尽到管理责任”的连带风险，建议完善内部反贿赂机制。

建议：根据行为性质选择处理路径，优先固定证据并咨询专业律师制定方案。如有进一步疑问，可直接向我提供细节（如聘用人员身份、好处费来源等），我将为您定制应对策略。