在商铺转让过程中，关于烟草证的处理确实是一个需要特别注意的法律环节。根据《烟草专卖许可证管理办法》及其实施细则，以下是对烟草证在商铺转让时如何处理的详细解答：
一、烟草证的不可转让性
首先，必须明确的是，烟草专卖许可证是严禁转让、出租、出借或以其他形式非法转让的。这意味着在商铺转让的过程中，原店主的烟草证不能直接转让给新店主。这是由法律严格规定的，旨在维护烟草市场的秩序和公平竞争。
二、原店主的责任与义务
- 歇业申请：
- 如果原店主在转让商铺后不再经营卷烟业务，应及时向当地烟草专卖局提出歇业（或注销）申请。这是原店主的一项重要法律义务，也是确保烟草证合法处理的关键步骤。
- 若原店主仍想继续从事烟草零售业务，但经营场所发生变动，则应在规定时间内向发证机关提出变更申请，而不是直接转让烟草证。
三、新店主的申请流程
重新申请：
- 新店主若想在转让后的商铺中经营烟草零售业务，必须在原店主办理完歇业手续后，重新向当地烟草专卖局提出烟草专卖零售许可证的申请。
申请材料：
- 新店主需要准备一系列材料，包括但不限于工商营业执照原件及复印件、法定代表人（负责人）身份证原件及复印件、经营场所的产权证明或租赁协议等。
- 同时，需要填写完整的申请书，并确保所有材料的真实性和合法性。
审核与发证：
- 烟草专卖局在收到申请后，会进行初步审核，并安排实地核查。核查内容主要包括经营场所是否符合烟草制品零售点合理布局的要求等。
- 如果新店主符合所有条件，烟草专卖局会在规定时间内依法作出准予行政许可的决定，并向新店主颁发新的烟草专卖零售许可证。
四、重要注意事项
合同约定：
- 在商铺转让过程中，双方应签订明确的转让合同，并在合同中明确约定烟草证的过户问题（虽然实际上烟草证不可转让，但应明确新店主将重新申请烟草证）。
- 合同中应详细列明双方的权利和义务以及违约责任等条款，以避免后续纠纷。
材料真实性：
- 新店主在申请新的烟草证时，应确保所提供的所有材料真实有效，并完全符合当地烟草专卖局的要求。
- 虚假材料可能导致申请被拒绝或面临法律责任。
法律咨询：
- 如果在商铺转让过程中遇到任何疑问或纠纷，建议双方及时咨询专业律师或相关机构的意见。
- 专业法律帮助可以确保整个转让过程的合法性和顺利性，避免不必要的法律风险。
结论
综上所述，商铺转让时烟草证的处理必须严格遵守相关法律法规。原店主需及时提出歇业申请（或变更申请，如果继续经营但场所变动），而新店主则需按照程序重新申请新的烟草专卖零售许可证。在整个过程中，双方应签订明确的转让合同，并确保所有材料的真实性和合法性。如有任何疑问或纠纷，应及时寻求专业法律帮助。