门店转让后涉及烟草证，必须签订协议。以下从不同角度为你详细分析：

1. 从法律合规性角度
   根据《烟草专卖许可证管理办法》规定，烟草专卖许可证不得买卖、出租、出借或以其他形式非法转让。若门店转让时未明确约定烟草证的处理方式，可能导致原持证人继续承担法律责任（如新经营者违规经营时，烟草专卖局可能追溯原持证人责任）。通过协议明确约定“烟草证随门店转让同步变更”或“原持证人协助注销/变更许可证”，可有效规避法律风险。

2. 从权利义务划分角度
   协议中需明确以下关键条款：

   • 烟草证变更责任方（如约定由受让方自行办理变更手续，原持证人配合提供材料）；
     
   • 变更期限（如自转让协议签订之日起30日内完成变更）；
     
   • 违约责任（如因一方原因导致变更失败，需赔偿对方损失）。
     若未签订协议，双方可能因“谁应负责变更”产生纠纷，甚至影响门店正常经营（如烟草部门因证件与实际经营者不符暂停供货）。

3. 从实际经营风险角度
   若未签订协议且未变更烟草证，可能出现以下风险：

   • 新经营者使用原烟草证进货，可能被认定为“无证经营”或“超范围经营”；
     
   • 原持证人可能因新经营者的违规行为（如销售假烟、乱渠道进货）被牵连处罚；
     
   • 门店转让后，若原持证人死亡或失联，烟草证变更将面临行政程序障碍。
     

建议操作步骤：

1. 转让前核实烟草证状态（是否在有效期内、有无被处罚记录）；
   
2. 在转让协议中单独列明“烟草证处理条款”，明确变更责任、期限及违约赔偿；
   
3. 协议签订后，双方共同到当地烟草专卖局办理变更或注销手续，保留书面凭证。
   

若涉及复杂情况（如烟草证与门店产权捆绑、转让方拒绝配合变更等），可进一步向我咨询具体解决方案。