商品房只有50年产权是合法的。以下从不同角度为您详细分析：

1. 产权年限的法律依据：

   • 根据我国《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第十二条的规定，土地使用权出让的最高年限按用途确定，其中居住用地的最高年限为70年，工业用地50年，教育、科技、文化、卫生、体育用地50年，商业、旅游、娱乐用地40年，综合或者其他用地50年。这里提到的“年限”是指土地使用权的出让年限，而非房屋本身的产权年限。房屋作为个人财产，其所有权是永久的，但房屋所占用的土地使用权有年限限制。
   • 在实际操作中，由于历史原因或特定规划需求，部分居住用地可能以综合用地或其他用途的名义出让，导致土地使用权年限为50年。这种情况下，商品房的产权年限（即土地使用权年限）为50年是合法的。

2. 产权年限与房屋使用的关系：

   • 产权年限（土地使用权年限）到期后，并不意味着房屋就不能使用了。根据《民法典》第三百五十九条的规定，住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期。续期费用的缴纳或者减免，依照法律、行政法规的规定办理。这意味着，即使土地使用权年限到期，房屋所有者仍然可以继续使用房屋，只需按照相关规定办理续期手续。
   • 对于非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，依照法律规定办理。该土地上的房屋以及其他不动产的归属，有约定的，按照约定；没有约定或者约定不明确的，依照法律、行政法规的规定办理。

3. 购房时的注意事项：

   • 在购买商品房时，购房者应仔细查看土地使用权出让合同或相关证明文件，了解土地使用权的年限和剩余年限。
   • 如果土地使用权年限较短，购房者应考虑未来续期的可能性和费用，以及这可能对房屋价值产生的影响。
   • 购房者还可以与开发商协商，在购房合同中明确土地使用权年限到期后的处理方式，以保障自己的合法权益。

法律建议：

• 如果您正在考虑购买只有50年产权的商品房，建议您在购房前详细了解土地使用权的年限、剩余年限以及续期政策。
• 您可以与开发商协商，在购房合同中明确相关条款，如土地使用权年限到期后的续期方式、费用承担等。
• 如果您对土地使用权年限或续期政策有疑问，可以向当地国土资源部门或房地产管理部门咨询，以获取更准确的信息。

可能的法律后果：

• 如果土地使用权年限到期后未办理续期手续，房屋所有者可能会面临无法继续使用房屋的风险。但根据现行法律规定，住宅建设用地使用权期限届满后是自动续期的，因此这一风险相对较低。
• 如果在购房过程中开发商未如实告知土地使用权年限或存在其他欺诈行为，购房者可以通过法律途径维护自己的合法权益。