结论前置：对方不付款后取消发票，再起诉对方一般不会有实质性负面影响，但需注意证据保留和诉讼时效问题。以下是具体分析：

1. 发票取消对合同关系和付款义务无实质影响

• 发票的开具和取消属于税务管理范畴，而合同双方的付款义务基于合同约定。即使发票被取消（如红字冲销），对方仍需按照合同履行付款义务，除非合同明确将“发票有效”作为付款前提（此类条款较少见且可能被认定为不合理）。
• 法律依据：根据《民法典》第五百零九条，当事人应按约定全面履行义务。发票状态不改变合同本身的效力。

2. 需注意证据保留问题

• 取消发票后，可能面临“无付款凭证”的风险。需保留以下证据：
  • 合同原件或电子版；
  • 送货单、验收单等履行证明；
  • 沟通记录（如微信、邮件）中对方承认欠款的内容；
  • 发票开具及取消的税务记录（如红字发票信息表）。
• 建议：起诉前整理所有能证明交易真实性和对方违约的证据，形成完整证据链。

3. 诉讼时效需关注

• 民事诉讼时效为3年，自知道或应当知道权利受损之日起算。若对方长期不付款，需确保在时效内起诉，否则可能丧失胜诉权。
• 例外：若双方在诉讼时效期间内有书面催款记录（如律师函、对账单签字），时效可中断并重新计算。

4. 税务合规风险需规避

• 取消发票需符合税务规定（如发生退货、服务未履行等）。若为恶意取消（如虚构交易），可能面临税务处罚，但此风险与对方付款义务无关，仅影响己方税务合规性。
• 操作建议：取消发票时留存税务机关要求的证明材料（如退货协议、情况说明）。

5. 起诉策略建议

• 诉讼请求：可同时主张本金、逾期利息（LPR的1.5倍）及维权合理支出（如律师费，若合同有约定）。
• 管辖法院：优先选择被告住所地或合同履行地法院，降低诉讼成本。
• 财产保全：起诉前可申请冻结对方银行账户或等值财产，防止转移资产。

总结：发票取消不影响通过法律途径追讨欠款，但需提前固定证据、关注时效并确保税务合规。如有具体案件细节（如合同条款、交易过程），可进一步提供材料，我将协助制定诉讼方案。