租赁车辆动用商业险赔付2000元是否合法，需结合具体情况判断，核心在于是否符合保险合同约定及法律规定。以下分情况说明：

1. 若事故属于商业险赔付范围，且赔付金额未超出合同约定限额，则合法
   商业险（如车损险、第三者责任险等）的赔付需以保险合同条款为依据。若事故符合合同约定的保险责任范围（如碰撞、自然灾害等），且2000元未超过对应险种的保额（如第三者责任险的保额为50万元，2000元在其范围内），则保险公司赔付2000元是合法的。此时需注意：

   • 租赁合同中是否明确约定了保险责任承担方（如承租人需承担部分责任）；
     
   • 赔付前是否已履行必要程序（如报警、定损、提供理赔材料等）。
     

2. 若事故不属于商业险赔付范围，或赔付金额超出合同约定，则可能不合法
   若事故属于商业险的免责情形（如故意制造事故、酒驾、无证驾驶等），或2000元赔付金额超过了合同约定的单次事故限额（如合同约定单次事故最高赔付1000元），则保险公司有权拒赔或要求调整赔付金额。此时需核查：

   • 保险合同中的“责任免除”条款；
     
   • 事故是否因承租人违规操作导致（如未按规定使用车辆）。
     

3. 若租赁合同另有约定，需以合同为准
   若租赁合同中明确约定了“事故赔付金额超过一定数额时，超出部分由承租人承担”（如合同约定“2000元以下由保险公司赔付，2000元以上部分由承租人承担”），则需按合同执行。此时需注意：

   • 合同条款是否违反法律强制性规定（如显失公平）；
     
   • 承租人是否在签约时被充分告知条款内容。
     

建议：若您是承租人，可要求租赁公司或保险公司出示保险合同，核对事故是否属于赔付范围、赔付金额是否合理；若您是租赁公司，需确保保险合同条款清晰，并在租赁合同中明确责任划分。如有争议，可进一步向我咨询具体细节。