乙方检举揭发甲方的违规行为，并不构成违法。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律原则角度
合法行为优先原则：
- 在法律框架内，公民有权利也有义务揭发和举报违法行为。这是维护社会秩序、保障公共利益的重要手段。
- 乙方与甲方之间的协议，若包含“乙方不能揭发甲方的违规协议”这样的条款，该条款本身可能因违反法律强制性规定或公序良俗而无效。因为法律不会保护或鼓励违法行为，也不会允许通过协议来限制公民的合法举报权利。
公序良俗原则：
- 公序良俗是法律的基本原则之一，它要求民事活动不得违反社会的公共秩序和善良风俗。
- 乙方揭发甲方的违规行为，是符合公序良俗的正当行为，不应受到法律的否定或限制。
二、合同效力角度
合同无效情形：
- 根据《民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。同时，违背公序良俗的民事法律行为也无效。
- 如果甲乙双方协议中的“乙方不能揭发甲方的违规协议”条款违反了上述规定，那么该条款自始无效，对乙方没有法律约束力。
合同解除与撤销：
- 即使该条款在合同中存在，乙方也有权基于合法理由（如甲方违规行为严重损害乙方利益或社会公共利益）请求解除或撤销合同中的相关部分。
三、法律后果角度
乙方检举揭发的合法性：
- 乙方检举揭发甲方的违规行为，是依法行使自己的权利，不会因此承担法律责任。
- 相反，如果乙方明知甲方存在违规行为而不揭发，可能会因纵容违法行为而承担一定的道德或法律责任（尽管这种责任在法律上可能并不明确）。
甲方可能面临的法律后果：
- 如果甲方的违规行为被查实，甲方可能会面临行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任等法律后果。
- 这与乙方是否揭发无关，而是甲方自身行为的结果。
四、实际操作建议
保留证据：
- 乙方在检举揭发前，应尽可能收集并保留甲方违规行为的证据，以便在需要时提供证明。
选择合法途径：
- 乙方应通过合法途径（如向相关部门举报、投诉等）进行检举揭发，避免采取过激或非法手段。
咨询专业律师：
- 如果乙方对检举揭发过程中的法律问题存在疑虑或担忧，可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。（不过，就本问题而言，我已给出明确法律意见，即乙方检举揭发不违法）
综上所述，乙方检举揭发甲方的违规行为并不构成违法。相反，这是乙方依法行使自己权利、维护社会秩序和公共利益的正当行为。如果乙方在检举揭发过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。