结论：交通事故中对方赔偿5000元，是否值得起诉需综合考量时间成本、经济成本、胜诉可能性及执行难度等因素。以下从多个维度进行分析，帮助您做出决策。

一、时间成本考量

1. 诉讼周期：打官司需要投入时间和精力，包括准备材料、出庭应诉等。如果案件复杂或对方拖延，诉讼周期可能较长，甚至可能超过数月。对于急需资金或时间宝贵的人来说，长时间等待可能影响生活和工作。
2. 建议：若您时间紧张，且赔偿金额不大，可优先考虑其他解决途径，如协商调解。

二、经济成本分析

1. 诉讼费用：虽然部分案件可能适用简易程序且诉讼费较低（如财产案件不满1万元的每件交纳50元），但律师费、鉴定费等额外支出可能增加负担。若聘请律师，费用可能在数千元至万元不等，具体取决于地区和服务内容。
2. 计算公式：总成本 = 诉讼费 + 律师费 + 鉴定费（如有） + 其他杂费。若总成本接近或高于5000元，则起诉的经济性可能降低。
3. 建议：在决定起诉前，务必计算总成本，并与预期获赔金额进行对比。若成本过高，可考虑放弃起诉或寻求其他解决途径。

三、胜诉可能性与赔偿金额评估

1. 证据充分性：需评估证据是否充分、责任划分是否合理及法律适用是否准确。若证据不足或责任划分不利，可能导致败诉或部分诉求被驳回。
2. 执行难度：即使胜诉，实际获赔金额可能因执行难度而缩水。例如，对方无财产可供执行时，判决可能成为“一纸空文”。
3. 建议：在起诉前，务必收集充分证据，并评估对方的履行能力。若证据不足或对方履行能力存疑，可考虑放弃起诉或寻求其他保障措施。

四、其他解决途径

1. 协商调解：通常更快捷高效，可通过保险公司或交警部门促成双方和解。协商调解不仅能节省时间和经济成本，还能维护双方关系。
2. 小额诉讼程序：适用于标的额较小的案件，具有流程简化、审理期限短的优势。若符合条件，可选择该程序以降低诉讼门槛并加速审理进程。
3. 建议：在决定起诉前，可先尝试协商调解或利用小额诉讼程序解决纠纷。若这些途径无法达成满意结果，再考虑起诉。

五、综合建议

1. 优先尝试协商解决：通过电话或面谈与对方沟通，明确诉求并寻求合理赔偿方案。可借助交警部门或保险公司居中调解，提高协商效率。
2. 评估诉讼成本与收益：计算总成本与预期获赔金额的差值。若成本接近或高于预期收益，需重新权衡诉讼必要性。
3. 利用小额诉讼程序：若符合条件，可选择该程序以降低诉讼门槛并加速审理进程。注意小额诉讼实行一审终审制，需在法定期间内提出异议。

总结：交通事故中对方赔偿5000元，是否值得起诉需根据您的具体情况进行判断。若您时间紧张、经济成本过高或胜诉可能性存疑，可优先考虑协商调解或利用小额诉讼程序解决纠纷。若您认为起诉是最佳选择，请务必收集充分证据并评估对方的履行能力。如有任何疑问或需要进一步帮助，请随时向我咨询。